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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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dxli75

铁虫 (初入文坛)


[资源] 分子模拟文件的转换软件!好用且免费!

分子模拟的软件较多,其相应的文件格式也较多!当相同体系在不同软件之间传递时,有时不能全部识别非常麻烦!
以前有个软件也很好用,但是要收费,好像是30美元!
现在这个软件是完全免费的,且几乎能识别所有格式的分子模拟文件!非常好用!
记住:使用前要首先设置可执行文件的路径!

不过有一个缺点,也可能是我还没有搞懂:hyperchem中建立的具有周期性的理想分子文件*.hin转换到MS中的*.CAR文件,周期性边界会消失! 我为此郁闷了很久,喜欢该软件的行家,不妨试试,帮我找找原因!

多谢!

抱歉!附件上传不全!给大家两个网址去下载吧!
免费的BABEL:
http://www.ccl.net/cca/software/UNIX/babel/index.shtml
收费/可试用的Mol2mol:
http://web.interware.hu/frenzy/mol2mol/index.html

[ Last edited by wuli8 on 2009-6-13 at 21:06 ]
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Babel是最基本的工具了,没啥新鲜的。
从网上可以得到最新的版本。
3楼2008-02-24 13:10:07
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dxli75

铁虫 (初入文坛)


第二、第三个附件:

[ Last edited by dxli75 on 2008-2-24 at 13:06 ]
2楼2008-02-24 12:56:35
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是啊,为啥不提个 openbabel 呢?呵呵……
4楼2008-02-24 13:54:43
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spur

金虫 (正式写手)


*.car 文件的数据是笛卡尔坐标,MS难以找出对称性和周期性。如果能转成分数坐标就解决问题了。
6楼2008-03-02 15:47:36
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