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chenxiang29

银虫 (正式写手)

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[求助] 蛋白序列与其它物种的一致性较低，说明什么问题？已有2人参与

我获得了一个新蛋白的基因序列，发现其成熟肽与其它物种一致性最高仅为36%，请问这能说明什么问题呢？谢谢

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smile to the world

1楼 2014-03-21 19:57:28

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yixuanwin

铁杆木虫 (正式写手)

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【答案】应助回帖

★ ★
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西门吹雪170: 金币+2, 鼓励回帖交流 2014-03-22 19:29:33

1/ 其他物种是指？  近缘、非近缘？多大尺度的近缘？

2  测序结果和蛋白注释确定无误？

3、基因序列翻译成蛋白，有多种可能。尝试检验。

4  如果GenBank比对结果不好，去专业的数据库比对

完毕。

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2楼2014-03-22 00:18:12

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lihe131

至尊木虫 (文坛精英)

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

30%以上就可以归为一个家族了，36%不算低了。

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3楼2014-03-22 10:07:08

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chenxiang29

银虫 (正式写手)

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引用回帖:

2楼: Originally posted by yixuanwin at 2014-03-22 00:18:12
1/ 其他物种是指？  近缘、非近缘？多大尺度的近缘？

2  测序结果和蛋白注释确定无误？

3、基因序列翻译成蛋白，有多种可能。尝试检验。

4  如果GenBank比对结果不好，去专业的数据库比对

完毕。

1.与genbank中所有物种比对结果一致性最高为36%
2.http://web.expasy.org/translate/ 翻译无误