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addict_cy

金虫 (小有名气)

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专业: 生物信息学

[交流] 推荐RhesusBase:一个整合1667套人、猴NGS数据的在线资源

如果你想根据RNA-Seq数据，研究一个基因在人、猴多组织中的表达，剪切和调控,
如果你想直观地在Genome Browser中看人、猴NGS数据的原始reads信息,
如果你想在一个整合有ChIP-Seq, poly(A)-Seq, CLIP-Seq等丰富注释信息的基因组框架下，研究一个基因的调控;

当你发现不同的RNA-Seq数据得到不同结论，纠结于哪一套数据更可靠、是否有规范化的NGS数据质量评分规则时,
当你发现一个基因及其调控模式在人-鼠之间存在巨大差异，想进一步了解在恒河猴中对应的情况时,
当你发现恒河猴的基因结构注释存在大量错误，没法开展分子生物学实验研究时,

请关注我们开发的恒河猴基因组知识库“RhesusBase“:
http://www.rhesusbase.org/

相关文献（如果RhesusBase的数据和分析流程对您的研究有帮助，请引用相应的论文，谢谢）：
For RhesusBase Gene Page, Genome Browser and Molecular Evolution Gateway:
1. Evolutionary Interrogation of Human Biology in Well-annotated Genomic Framework of Rhesus Macaque. Molecular Biology and Evolution, 2014.
http://mbe.oxfordjournals.org/co ... 03/17/molbev.msu084
2. RhesusBase: a Knowledgebase for the Monkey Research Community. Nucleic Acids Research, 2013.
http://nar.oxfordjournals.org/content/41/D1/D892.full

For Original NGS Datasets in RhesusBase:
- For strand-specific RNA-Seq data in multiple tissues of the same animal, please cite:
3. Hominoid-specific De Novo Protein-coding Genes Originating from Long Non-coding RNAs. PLoS Genetics, 2012
http://www.plosgenetics.org/arti ... ournal.pgen.1002942

- For strand specific RNA-Seq data from multiple tissues, as well as the whole genome sequencing data (60x) of the same animal, please cite:
4. RNA Editome in Rhesus Macaque Shaped by Purifying Selection. PLoS Genetics, 2014, doi:10.1371/
journal.pgen.1004274. in press

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