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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 请问用优化好的结构算拉曼光谱用LOG文件里哪个坐标啊
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cczjkd

木虫 (正式写手)

[求助] 请问用优化好的结构算拉曼光谱用LOG文件里哪个坐标啊 已有1人参与

是该用 Standard orientation这个坐标吗？
Standard orientation:                        
---------------------------------------------------------------------
Center     Atomic     Atomic              Coordinates (Angstroms)
Number     Number      Type              X           Y           Z
---------------------------------------------------------------------
    1         74             0       -1.472719    1.661805    0.121012
    2         74             0        1.472719    1.661805    0.121012
    3         74             0        1.472719   -1.661805    0.121012
    4         74             0       -1.472719   -1.661805    0.121012
    5         74             0        0.000000    0.000000   -1.547525
    6         74             0        0.000000    0.000000    1.547699
    7         74             0        0.000000    2.602167   -1.531003
    8         74             0        0.000000   -2.602167   -1.531003
    9         74             0        0.000000   -2.757935    1.687926
   10         74             0        0.000000    2.757935    1.687926
   11          6             0        0.000000    0.000000   -3.527830
   12          8             0        0.000000    0.000000   -4.736262
---------------------------------------------------------------------
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1楼 2014-03-18 15:57:48
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
★ ★ ★
gkf高: 金币+3 2014-03-19 09:29:58
标准坐标方位和输入坐标方位对应的结构没有区别，只不过前者在后者基础上加上平移和转动。如果只用结构数据（画分子结构，提取结构做新的计算，等等），用任何一个都可以。

偶极矩矢量等分子性质、频率计算的振动模式、Hessian、偶极矩导数、B矩阵、...都基于标准坐标方位
赞一下 回复此楼
beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
3楼2014-03-18 21:33:58
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+2 2014-03-18 20:54:56
cczjkd: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-04-26 11:10:07
结构优化的log文件中最后一组坐标，在4个YES之后输出的。
但我建议直接读取结构优化的chk文件来算，这样可以保证频率计算所使用的是优化好的结构。
赞一下 回复此楼
2楼2014-03-18 16:16:15
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cczjkd

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2014-03-18 16:16:15
结构优化的log文件中最后一组坐标，在4个YES之后输出的。
但我建议直接读取结构优化的chk文件来算，这样可以保证频率计算所使用的是优化好的结构。

直接读取CHK文件  # freq=raman guess=read geom=check ub3lyp/lanl2dz 这样可以吗？
赞一下 回复此楼
4楼2014-03-19 22:11:12
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cczjkd at 2014-03-19 22:11:12
直接读取CHK文件  # freq=raman guess=read geom=check ub3lyp/lanl2dz 这样可以吗？...

应该是可以的
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5楼2014-03-20 07:05:41
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