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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 晶体解析 » 求助： 有关绝对构型的确定？？？
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zengmi

金虫 (小有名气)

[交流] 求助： 有关绝对构型的确定？？？

弱弱培养了一个含有氯原子的手性化合物的单晶，通过X- ray 衍射了，数据已经拿到，但是如何确定他的绝对构型，弱弱一无所知，希望各位强强大哥帮忙解释一下，谢谢了！！！还有，就是弱弱已经把单晶的结构图都拿到了的

[ Last edited by zengmi on 2008-2-19 at 12:58 ]
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1楼 2008-02-19 12:30:52
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚
解结构的那帮人打死也不说？
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2楼2008-02-19 12:44:30
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zengmi

金虫 (小有名气)
他也不知道，他只会用仪器了。就像很多人会用电脑一样，其中的道理也搞不明白，大家帮帮忙了
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3楼2008-02-19 12:56:08
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iphyaries

铁杆木虫 (小有名气)

在用SHELX解结构的时候会自动计算出来Flack x参数

不知道你的结构是不是用SHELXTL解的，如果是，那么在解结构的过程中程序会自动计算出Flack x参数及其不确定度esd，如果esd足够小，最好esd<0.1，那么Flack x参数就可以确定绝对构型。如果Flack x~0，说明你现在的构型是对的，如果~1，则说明定反了。这一步是在XL精修的时候做的，你需要去.lst文件中找这个参数的值。

大概是这样的形式
Flack x parameter =  -0.0212   with esd  0.0302
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Ineedlearnmore...
4楼2008-02-19 13:17:35
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iphyaries

铁杆木虫 (小有名气)

SHELX说明书里里关于绝对构型的部分

Since the structure is non-centrosymmetric, the program has automatically estimated the Flack absolute structure parameter x in the final structure factor summation. In this example x is within one esd of zero, and its esd is also relatively small. This provides strong evidence that the absolute structure has been assigned correctly, so that no further action is required. The program would have printed a warning here if it would have been necessary to 'invert' the structure or to refine it as a racemic twin.
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Ineedlearnmore...
5楼2008-02-19 13:38:19
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lilywang501

金虫 (小有名气)
在.cif文件中会有FLACK参数，如果是~0，说明你的结构中只有一种构象，如果是0.5说明是两种构象同时存在，具体是那种构象，你可以观察不对称结构基元中手性原子周围的基团类型，按照有机化学中，关于R和S构型的规则，进行判断。
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6楼2008-03-14 15:55:53
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