24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1648  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

cumt111

专家顾问

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

[求助] 帮忙用导出的高岭石结构的cif文件画出用于gaussian优化的结构,紧急 已有2人参与

在网上数据库下了高岭石晶体结构的cif文件,想用gaussian优化结构后计算与药剂分子的作用,然后下载了Mercury 3.3转成了gaussian能打开的文件,但是优化一直出错,才发现可能导出的晶体结构可能不完整,但是由于时间原因和专业知识所限,我也不会调整这个,恳请哪位大侠能否帮我画出这个结果?万分感谢!
回复此楼
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sxm2012

版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
cumt111: 金币+30, ★★★很有帮助 2014-03-16 11:24:52
gview可以打开.cif文件,然后转换成.gjf文件,就可以用gaussian优化了!
3楼2014-03-16 11:23:28
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

cumt111

版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

补充一下原子坐标:

0 2
Al                 1.28700000    1.48960000    0.00000000
Si                -0.56439395    4.28359151    3.18857757
Si                -0.25415311    1.53772664    2.80891826
O                 -0.90651793    4.16295527    1.61956953
O                 -0.66173720    1.99646163    1.32001747
O                 -0.21863681    2.82468689    3.77631686
O                  0.70289298    5.25696536    3.38836579
O                  1.20098430    0.84848244    2.77882320
Al                 3.86100000    2.97040000    0.00000000
O                  2.14160000    2.97040000    1.08720000
O                  0.43240000    0.00000000   -1.08720000
O                  0.43240000    2.97040000   -1.08720000
O                  3.00640000    1.48960000   -1.08720000
Al                -1.28700000    5.94960000    0.00000000
Si                 1.99970613    0.71419826    1.38691826
Si                 1.41030130    5.93087449    2.10820638
O                  4.71559999    4.46000004    1.08719998
O                  2.79842672    0.57991522   -0.00498750
O                  4.71560000    1.48960000    1.08720000
O                 -1.33722273    0.48127559    3.36051552
O                 -1.83531405    4.88975851    3.97005811
Al                -1.28700000    2.97040000    0.00000000
Al                 1.28700000   -1.48960000    0.00000000
O                  3.00640000    4.46000000   -1.08720000
O                  5.58040002    2.97040001   -1.08720004
H                  4.15136145    4.67579841    1.83330047
H                  4.15171812    1.27445267    1.83375800
H                 -1.23917441    0.10802386    4.23953183
H                 -1.79481384    5.02585090    4.91949931
H                  2.17306871    4.71324031   -0.68343235
H                  6.20733530    3.58221107   -0.69446684
2楼2014-03-16 11:10:13
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cumt111

版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
3楼: Originally posted by sxm2012 at 2014-03-16 11:23:28
gview可以打开.cif文件,然后转换成.gjf文件,就可以用gaussian优化了!

会不会出现优化不出来的情况?
4楼2014-03-16 11:25:59
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sxm2012

实习版主

优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!优秀!!有木有!!!

引用回帖:
4楼: Originally posted by cumt111 at 2014-03-16 11:25:59
会不会出现优化不出来的情况?...

先结构优化试试看!
5楼2014-03-16 13:14:19
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 309分085801求调剂 +7 学员Gtwj7W 2026-03-31 7/350 2026-04-01 02:36 by BruceLiu320
[考研] 271求调剂 +9 勒布朗@ 2026-03-31 11/550 2026-04-01 01:32 by 1018329917
[考研] 311(085601)求调剂 +12 liziyeyeye 2026-03-28 13/650 2026-04-01 00:34 by fmesaito
[考研] 省双一流重点一本大学招收调剂 +3 wwwwffffff 2026-03-31 5/250 2026-03-31 19:49 by 曾曾曾!
[考研] 考研材料工程351分调剂 +4 整个好的 2026-03-31 4/200 2026-03-31 19:36 by 难0121
[考研] 安徽大学专硕生物与医药专业(086000)324分,英语已过四六级,六级521,求调剂 +10 美味可乐鸡翅 2026-03-26 11/550 2026-03-31 19:20 by syh9288
[考研] 285求调剂 +6 AZMK 2026-03-30 11/550 2026-03-31 17:33 by AZMK
[考研] 311求调剂 +9 蓝月亮亮 2026-03-30 9/450 2026-03-31 16:32 by yedezhan
[考研] 材料与化工272求调剂 +25 阿斯蒂芬2004 2026-03-28 25/1250 2026-03-31 16:27 by hypershenger
[考研] 263求调剂 +3 DDDDuu 2026-03-27 3/150 2026-03-31 16:21 by 土木硕士招生
[考研] 一志愿大连理工大学材料求调剂 +6 Gymno 2026-03-30 6/300 2026-03-31 07:26 by 无际的草原
[考研] 083000环境科学与工程调剂,总分281 +4 橙子(胜意) 2026-03-30 4/200 2026-03-31 00:44 by Linzejun
[考研] 322求调剂 +10 宋明欣 2026-03-27 10/500 2026-03-30 18:47 by 544594351
[考研] 284求调剂 +14 junqihahaha 2026-03-26 15/750 2026-03-30 14:12 by 探123
[考研] 一志愿中南大学化学0703总分337求调剂 +6 niko- 2026-03-27 6/300 2026-03-30 10:25 by herarysara
[考研] 343求调剂085601 +3 要努力学习x 2026-03-29 3/150 2026-03-29 18:35 by wxiongid
[考研] 求调剂 +7 争取九点睡 2026-03-28 8/400 2026-03-28 21:07 by 争取九点睡
[考研] 复试调剂,一志愿南农083200食品科学与工程 +5 XQTJZ 2026-03-26 5/250 2026-03-27 14:49 by 狂炫麦当当
[考研] 一志愿郑大085600,310分求调剂 +5 李潇可 2026-03-26 5/250 2026-03-27 11:14 by 不吃魚的貓
[考研] 【2026考研调剂】制药工程 284分 求相关专业调剂名额 +4 袁奂奂 2026-03-25 8/400 2026-03-25 14:32 by lbsjt
信息提示
请填处理意见