24小时热门版块排行榜    

查看: 1575  |  回复: 14

nima0332

银虫 (小有名气)

[求助] 如何在Linux上导入写好的gaussian的gif文件

输入指令: g09 111.gjf &   之后显示:
                    “[1]  3085”,再次输入也是出现"[1]  xxx(数字)"等;
输入指令:        g09  111.gjf     之后电脑无法操作,一段时间后显示:
                            “[1]+  Done                          g09 111.gjf”
是不是哪里操作有问题呢?
小弟在centOS上安装好g09,之后在自己笔记本上生成输入文件(里面随意摆放了三四个水分子)想算算之间存在的氢键。



输入文件:
-------------------------------------------
%chk=di.chk
%nproc=3
#n b3lyp/6-311G**   opt

0  1
title

原子坐标省略
--------------------------------------------
回复此楼
仁者不以盛衰改节,义者不以生死易心
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

黄金比例

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
g09 < 123.gjf > 123.log &

20个金币!!!!

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
2楼2014-03-12 15:15:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jyzhao1981

木虫 (正式写手)

你没有将gaussian的进程放到后台,你运行g09 1.gjf&,  然后top查看一下,就能看到l301,  l401, l502这样的进程了
人生需要多少等待?
12楼2014-03-13 09:42:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

黄金比例

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
nima0332: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢您能回复我!! 2014-03-12 16:30:13
< 和 > 前后加个空格

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
3楼2014-03-12 15:18:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nima0332

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 黄金比例 at 2014-03-12 15:18:10
< 和 > 前后加个空格

大哥,小弟试了一下,还是不行哇,输入了:
g09 <1.gjf> 1.log &
或者:
g09 < 1.gjf > 1.log &
都不行哇~~~
仁者不以盛衰改节,义者不以生死易心
4楼2014-03-12 15:43:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黄金比例

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by nima0332 at 2014-03-11 19:43:36
大哥,小弟试了一下,还是不行哇,输入了:
g09 <1.gjf> 1.log &
或者:
g09 < 1.gjf > 1.log &
都不行哇~~~...

必须进入到 1.gjf文件的目录中。
返回什么提示???

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2014-03-12 16:24:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nima0332

银虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 黄金比例 at 2014-03-12 16:24:26
必须进入到 1.gjf文件的目录中。
返回什么提示???
...

我把 1.gjf 放到了scratch 文件夹,cd到了这个文件夹没然后执行命令的~
仁者不以盛衰改节,义者不以生死易心
6楼2014-03-12 16:29:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黄金比例

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
nima0332: 金币+20, ★★★很有帮助 2014-03-12 16:40:45
引用回帖:
6楼: Originally posted by nima0332 at 2014-03-11 20:29:40
我把 1.gjf 放到了scratch 文件夹,cd到了这个文件夹没然后执行命令的~...

看看是不是在运行了

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
7楼2014-03-12 16:35:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nima0332

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 黄金比例 at 2014-03-12 16:35:22
看看是不是在运行了
...

这个还真是问住我了。。windows下,运行后窗口里面,有结果不断在刷出来~~~
我刚在linux下面,算了个最简单的文件。。过了一会儿显示:
[1]+  Done            g09 2.gjf
这是不是显示算完了哇。。
期间我执行 ”ps“,发现g09确实是在运行的。。。
仁者不以盛衰改节,义者不以生死易心
8楼2014-03-12 16:40:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nima0332

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 黄金比例 at 2014-03-12 16:35:22
看看是不是在运行了
...

大哥,请问在哪里去查看计算结果呢。。
仁者不以盛衰改节,义者不以生死易心
9楼2014-03-12 16:43:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黄金比例

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
nima0332: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 帮助了水生火热的不合格菜鸟!!感激! 2014-03-12 16:53:26
done 就是算完了,log文件与gjf文件在同一个目录!

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
10楼2014-03-12 16:43:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 nima0332 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 299求调剂 +6 △小透明* 2026-03-17 6/300 2026-03-21 02:42 by JourneyLucky
[考研] 化学求调剂 +4 临泽境llllll 2026-03-17 5/250 2026-03-21 02:23 by JourneyLucky
[考研] 265求调剂 +9 梁梁校校 2026-03-17 9/450 2026-03-21 02:17 by JourneyLucky
[考研] 299求调剂 +4 shxchem 2026-03-20 5/250 2026-03-21 00:24 by 星空星月
[考研] 308求调剂 +3 阿姐阿姐家啊 2026-03-18 3/150 2026-03-20 23:24 by JourneyLucky
[考研] 260求调剂 +3 朱芷琳 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:35 by 学员8dgXkO
[考研] 353求调剂 +3 拉钩不许变 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:56 by JourneyLucky
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +7 困于星晨 2026-03-17 9/450 2026-03-20 17:38 by 无懈可击111
[考研] 0856调剂,是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
[考研] 085601材料工程专硕求调剂 +10 慕寒mio 2026-03-16 10/500 2026-03-19 15:26 by 丁丁*
[考研] 328求调剂,英语六级551,有科研经历 +4 生物工程调剂 2026-03-16 12/600 2026-03-19 11:10 by 生物工程调剂
[考研] 收复试调剂生 +4 雨后秋荷 2026-03-18 4/200 2026-03-18 14:16 by elevennnne
[考研] 0703化学调剂 +3 妮妮ninicgb 2026-03-17 3/150 2026-03-18 10:29 by macy2011
[考研] 材料,纺织,生物(0856、0710),化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考博] 26博士申请 +3 1042136743 2026-03-17 3/150 2026-03-17 23:30 by 轻松不少随
[考研] 0854控制工程 359求调剂 可跨专业 +3 626776879 2026-03-14 9/450 2026-03-16 17:42 by 626776879
[考研] 304求调剂 +4 ahbd 2026-03-14 4/200 2026-03-16 16:48 by 我的船我的海
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见