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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 如何在Linux上导入写好的gaussian的gif文件
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nima0332

银虫 (小有名气)

[求助] 如何在Linux上导入写好的gaussian的gif文件

输入指令： g09 111.gjf &   之后显示：
                    “[1]  3085”，再次输入也是出现"[1]  xxx（数字）"等；
输入指令：        g09  111.gjf     之后电脑无法操作，一段时间后显示：
                            “[1]+  Done                          g09 111.gjf”
是不是哪里操作有问题呢？
小弟在centOS上安装好g09，之后在自己笔记本上生成输入文件（里面随意摆放了三四个水分子）想算算之间存在的氢键。



输入文件：
-------------------------------------------
%chk=di.chk
%nproc=3
#n b3lyp/6-311G**   opt

0  1
title

原子坐标省略
--------------------------------------------
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仁者不以盛衰改节，义者不以生死易心
1楼 2014-03-12 15:13:49
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黄金比例

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
g09 < 123.gjf > 123.log &

20个金币！！！！

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2楼2014-03-12 15:15:43
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jyzhao1981

木虫 (正式写手)
你没有将gaussian的进程放到后台，你运行g09 1.gjf&，  然后top查看一下，就能看到l301,  l401, l502这样的进程了
赞一下(1人) 回复此楼
人生需要多少等待？
12楼2014-03-13 09:42:39
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普通回帖

黄金比例

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
nima0332: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢您能回复我！！ 2014-03-12 16:30:13
< 和 > 前后加个空格

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3楼2014-03-12 15:18:10
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nima0332

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 黄金比例 at 2014-03-12 15:18:10
< 和 > 前后加个空格

大哥，小弟试了一下，还是不行哇，输入了：
g09 <1.gjf> 1.log &
或者：
g09 < 1.gjf > 1.log &
都不行哇~~~
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仁者不以盛衰改节，义者不以生死易心
4楼2014-03-12 15:43:36
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黄金比例

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by nima0332 at 2014-03-11 19:43:36
大哥，小弟试了一下，还是不行哇，输入了：
g09 <1.gjf> 1.log &
或者：
g09 < 1.gjf > 1.log &
都不行哇~~~...

必须进入到 1.gjf文件的目录中。
返回什么提示？？？

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5楼2014-03-12 16:24:26
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nima0332

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by 黄金比例 at 2014-03-12 16:24:26
必须进入到 1.gjf文件的目录中。
返回什么提示？？？
...

我把 1.gjf 放到了scratch 文件夹，cd到了这个文件夹没然后执行命令的~
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6楼2014-03-12 16:29:40
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黄金比例

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
nima0332: 金币+20, ★★★很有帮助 2014-03-12 16:40:45
引用回帖:
6楼: Originally posted by nima0332 at 2014-03-11 20:29:40
我把 1.gjf 放到了scratch 文件夹，cd到了这个文件夹没然后执行命令的~...

看看是不是在运行了

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7楼2014-03-12 16:35:22
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nima0332

银虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 黄金比例 at 2014-03-12 16:35:22
看看是不是在运行了
...

这个还真是问住我了。。windows下，运行后窗口里面，有结果不断在刷出来~~~
我刚在linux下面，算了个最简单的文件。。过了一会儿显示：
[1]+  Done            g09 2.gjf
这是不是显示算完了哇。。
期间我执行 ”ps“，发现g09确实是在运行的。。。
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仁者不以盛衰改节，义者不以生死易心
8楼2014-03-12 16:40:27
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nima0332

银虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 黄金比例 at 2014-03-12 16:35:22
看看是不是在运行了
...

大哥，请问在哪里去查看计算结果呢。。
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9楼2014-03-12 16:43:09
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黄金比例

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
nima0332: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 帮助了水生火热的不合格菜鸟！！感激！ 2014-03-12 16:53:26
done 就是算完了，log文件与gjf文件在同一个目录！

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10楼2014-03-12 16:43:17
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