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yuanf2011

银虫 (正式写手)

[求助] 文本中的氢键数据如何显现呢 已有1人参与

求助各位大侠!晶体解析出来以后如何导出txt文件出现氢键表呢?txt文件我可以导出来,但是txt文件没有氢键数据(比如像这样的氢键O3-H3B…O2i, 2.948Å, 173°, symmetry code i: (x+1/2,-y+3/2,-z+1); O3-H3A…Cl1v, 3.275 Å, 150°, symmetry code v: (−x+2, −y+1, −z+1)),急求如何解决呢?文章需要。谢谢各位了!!!
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p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这个需要在你的最新ins文件中加入下列指令:(这些指令帮助在cif文件里生成氢键数据)

eqiv $1 x+1/2,-y+3/2,-z+1
eqiv $2 −x+2, −y+1, −z+1
HTAB O3 O2i_$1
HTAB O3 Cl1v_$2

加完以后,存好,再做refine把氢键列表写到cif文件里,然后再做txt文件生成,应该就会产生相应的H键列表了。
老歪博
2楼2014-03-12 17:38:15
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yuanf2011

银虫 (正式写手)

那我怎么知道在指令中如何设置他们的对称操作码呢还有O2i和cl1V中的角码i和v应该如何编辑呢
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3楼2014-03-12 20:56:17
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