| 查看: 603 | 回复: 2 | |||
| 当前主题已经存档。 | |||
itismineok捐助贵宾 (正式写手)
|
[交流]
推荐一个MD结果分析用脚本网站
|
||
|
简介：看原文吧！ MDAnalysis is a python framework to analyze molecular dynamics trajectories generated by Charmm, NAMD, or LAMMPS (Gromacs support is in the working...). It allows one to read molecular dynamics trajectories and access the atomic coordinates through numpy arrays. This provides an extremely flexible and relatively fast framework for complex analysis tasks. In addition, Charmm-style atom selection commands are implemented. Trajectories can also be manipulated (for instance, fit to a reference structure) and written out. It is inspired by the Schulten Group's MDtools for Python, and the DCD reading code is derived from VMD's catdcd. MDAnalysis is GPL licensed, except for the dcd reading code (UIUC Open Source Licence, GPL-compatible). Some time-critical routines are written in C or pyrex and require a working C compiler and pyrex........... http://code.google.com/p/mdanalysis/ |
回复此楼» 猜你喜欢
香港科技大学（广州）诚招电催化方向博士生（2026秋入学）
已经有0人回复
-
散金
已经有87人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有168人回复
-
浙江师范大学国家杰青杨启华教授团队招收2026年博士研究生
已经有34人回复
-
求助Cu2+1O的CIF文件(PDF: 05-0667)
已经有1人回复
-
KAUST（阿卜杜拉国王科技大学）MXene 器件方向博士后招聘
已经有0人回复
-
沙特阿拉伯阿卜杜拉国王科技大学（KAUST）电池方向博士后招聘
已经有0人回复
-
分子动力学模拟合作需求
已经有0人回复
-
福州大学新能源材料与工程研究院招收2026年入学博士
已经有0人回复
-
南通大学电气与自动化学院2026年优秀博士招聘公告
已经有0人回复
yalefield
金虫 (文坛精英)
老汉一枚
- QC强帖: 1
- 应助: 129 (高中生)
- 贵宾: 0.17
- 金币: 21238.9
- 散金: 3440
- 红花: 66
- 帖子: 12101
- 在线: 759.1小时
- 虫号: 96063
- 注册: 2005-10-07
- 专业: 高等教育学
- 管辖: 计算模拟
2楼2008-02-12 09:30:38
weishenme
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 981.3
- 帖子: 128
- 在线: 52.6小时
- 虫号: 45892
- 注册: 2004-05-15
- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
3楼2008-02-14 16:00:56