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moirakaola

银虫 (小有名气)

[求助] CASTEP运行报错 已有1人参与

请各位高手帮忙!Existing close contacts have been found between particles, within tolerance=0.1 Angstrom
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tuhao2004

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2014-03-21 17:26:52
可能是输入的晶体结构里面有原子相互之间靠的太紧了,楼主要不检查下输入的结构里面有没靠的太近的两个原子。结构没错的话,把tolerance改大点。
2楼2014-03-14 21:32:18
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moirakaola

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tuhao2004 at 2014-03-14 21:32:18
可能是输入的晶体结构里面有原子相互之间靠的太紧了,楼主要不检查下输入的结构里面有没靠的太近的两个原子。结构没错的话,把tolerance改大点。

谢谢你的回复。怎么检查是否有两个原子的距离靠的太近呢?若是没有的话,怎么改tolerance呢?
3楼2014-03-16 10:40:22
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tuhao2004

木虫 (正式写手)

★ ★
sunyang1988: 金币+2, 谢谢交流 2014-03-21 17:27:00
引用回帖:
3楼: Originally posted by moirakaola at 2014-03-16 10:40:22
谢谢你的回复。怎么检查是否有两个原子的距离靠的太近呢?若是没有的话,怎么改tolerance呢?...

原子比较少的话,一个一个位置看,八成有的位置有重叠的原子,如果删掉一个那个位置重叠的原子后运行不出现那个提示的话那就是的了,其他的先进方法我还不会。至于tolerance,之前我还没仔细看,这个tolerance我没找到能改的地方,你还得问问高手。
如果你是从findit直接导入cif文件到MS的话出现这种我也遇到,就改从文献找原始数据自己建一个模型。
我也是死菜鸟,这里献丑了。
4楼2014-03-17 19:29:46
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moirakaola

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by tuhao2004 at 2014-03-17 19:29:46
原子比较少的话,一个一个位置看,八成有的位置有重叠的原子,如果删掉一个那个位置重叠的原子后运行不出现那个提示的话那就是的了,其他的先进方法我还不会。至于tolerance,之前我还没仔细看,这个tolerance我没 ...

谢谢你的回复
5楼2014-03-18 09:28:49
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