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前田庆次

木虫 (著名写手)

[求助] 求教:我的CPU使用率是多少?

top - 15:37:32 up 3 days,  8:43,  4 users,  load average: 16.00, 16.01, 15.99
Tasks: 307 total,  17 running, 290 sleeping,   0 stopped,   0 zombie
Cpu(s): 50.5%us,  0.2%sy,  0.0%ni, 49.3%id,  0.0%wa,  0.0%hi,  0.0%si,  0.0%st
Mem:    129171M total,    68940M used,    60231M free,      225M buffers
Swap:        0M total,        0M used,        0M free,    32356M cached

  PID USER      PR  NI  VIRT  RES  SHR S %CPU %MEM    TIME+  COMMAND            
18469 miller    20   0 2575m 2.1g  28m R  100  1.7  27:22.11 vasp               
18473 miller    20   0 2571m 2.1g  28m R  100  1.7  27:53.82 vasp               
18475 miller    20   0 2571m 2.1g  28m R  100  1.7  27:53.68 vasp               
18476 miller    20   0 2575m 2.1g  27m R  100  1.7  27:53.72 vasp               
18481 miller    20   0 2572m 2.1g  27m R  100  1.7  27:54.13 vasp               
18483 miller    20   0 2571m 2.1g  27m R  100  1.7  27:54.05 vasp               
18484 miller    20   0 2575m 2.1g  28m R  100  1.7  27:53.92 vasp               
18470 miller    20   0 2577m 2.1g  28m R   99  1.7  27:53.77 vasp               
18471 miller    20   0 2574m 2.1g  29m R   99  1.7  27:53.76 vasp               
18472 miller    20   0 2578m 2.1g  28m R   99  1.7  27:54.09 vasp               
18474 miller    20   0 2573m 2.1g  28m R   99  1.7  27:54.06 vasp               
18477 miller    20   0 2571m 2.1g  28m R   99  1.7  27:53.74 vasp               
18478 miller    20   0 2573m 2.1g  28m R   99  1.7  27:53.69 vasp               
18479 miller    20   0 2571m 2.1g  28m R   99  1.7  27:54.14 vasp               
18482 miller    20   0 2574m 2.1g  27m R   99  1.7  27:53.73 vasp               
18480 miller    20   0 2575m 2.1g  27m R   98  1.7  27:53.93 vasp               
1714 root      20   0  143m  33m 7452 S    6  0.0 181:28.70 Xorg

这一行:
Cpu(s): 50.5%us,  0.2%sy,  0.0%ni, 49.3%id,  0.0%wa,  0.0%hi,  0.0%si,  0.0%st
怎么显示只使用了50.5%?但是线面的CPU使用率基本是100%?
到底CPU的使用率是多少???
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长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

Top命令下按1,可出现cpu的分配,进程内无法直接看到。有时候开销很有可能在sys那一项上。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
2楼2014-03-07 23:24:07
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

上面说错了你cpu正好50%很有可能是超线程没关闭。刚刚没注意你总的sys。要是不关闭超线程你就把np设定成当前的两倍吧。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
3楼2014-03-07 23:27:33
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前田庆次

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-03-07 23:27:33
上面说错了你cpu正好50%很有可能是超线程没关闭。刚刚没注意你总的sys。要是不关闭超线程你就把np设定成当前的两倍吧。

前辈,难道我一直都只用了八个核???太可怕了!
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
4楼2014-03-08 00:02:56
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前田庆次

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-03-07 23:27:33
上面说错了你cpu正好50%很有可能是超线程没关闭。刚刚没注意你总的sys。要是不关闭超线程你就把np设定成当前的两倍吧。

真的只用了50%吗,太可怕了,超线程确实一直没关
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
5楼2014-03-08 00:04:43
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
5楼: Originally posted by 前田庆次 at 2014-03-08 00:04:43
真的只用了50%吗,太可怕了,超线程确实一直没关...

那就是这个问题了。也不是说不能开着,现在1个core对应两个线程,mpirun要是没记错应该是根据线程来算的。我们这边测试的结果觉得超线程慢一些。你试试看mpirun -np 16看看会不会出错,再比较一下速度,问题就很显然了。

BIOS下的应该在process的选项,有个Hyper Threading可以关掉,另外Virtual Tech建议也关掉,前两天帮忙搭集群联想的人和我说的。我估计我称呼你是前辈才比较恰当。。。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
6楼2014-03-08 00:51:36
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前田庆次

木虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-03-08 00:51:36
那就是这个问题了。也不是说不能开着,现在1个core对应两个线程,mpirun要是没记错应该是根据线程来算的。我们这边测试的结果觉得超线程慢一些。你试试看mpirun -np 16看看会不会出错,再比较一下速度,问题就很显 ...

兄弟 我才进入第一性领域4个月 哈哈
现在改为mpirun -np 32好多了,利用率一直浮动,但是绝对比50%高,sy那一项是什么呢,是system吗?系统利用?
兄弟点应助啊,解决我一个大问题啊
长枪一横花飘零,松风追月伴我行。无双人间世如梦,倾奇万世永留名。
7楼2014-03-08 09:46:19
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卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
7楼: Originally posted by 前田庆次 at 2014-03-08 09:46:19
兄弟 我才进入第一性领域4个月 哈哈
现在改为mpirun -np 32好多了,利用率一直浮动,但是绝对比50%高,sy那一项是什么呢,是system吗?系统利用?
兄弟点应助啊,解决我一个大问题啊...

只是多看了点linux的资料而已,我本行不是做第一原理的。sys那一项是系统开销,你的sys那一项不太大,根本不是第一种情况。在跨节点并行的时候效率不佳就经常sys飙升,cpu用于信息交换。我看你cpu正好50%,很快就想到是超线程的问题,再检查sys那一项就能断定了,建议关掉超线程,,效率估计还会有提升。解决问题就好。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
8楼2014-03-08 09:52:42
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前田庆次

木虫 (著名写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-03-08 09:52:42
只是多看了点linux的资料而已,我本行不是做第一原理的。sys那一项是系统开销,你的sys那一项不太大,根本不是第一种情况。在跨节点并行的时候效率不佳就经常sys飙升,cpu用于信息交换。我看你cpu正好50%,很快就想 ...

多谢大侠相助啊,果真现在速度快多了,太给力了!
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9楼2014-03-08 17:03:09
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