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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 文献解析 » 求助：DIAMOND 使用出现的问题
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linxiaoming

铁虫 (小有名气)

[交流] 求助：DIAMOND 使用出现的问题

之前用DIAMOND打开CIF文件时都很正常的，也也得到正确的分子结构图。前两天不知道自己改了什么设置就乱了，每次打开先前的CIF文都得不了完整的结构了。有时候多了很多多余的短键，也连接不起来的，这么回事呢？以附件里的为例子吧。我打开一个DIAMOND 里自带CIF文件--pyrene.但却无法得到完整的分子如图一。没办法，手动点了connect atoms，却只是连接了一部分的原子如 如图二。以前一打开就是一个完整的分子图，现在不知道哪里设置出了问题，麻烦各位大侠提供点方法吧？先谢谢了
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1楼 2008-02-05 15:01:57
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wsoso

木虫 (正式写手)

diamond低手的建议

在BUILD中操作：
1. 选择distroy all，再add所有的原子，这时估计会出现原子间没有键连接，或者胡乱连接；
2. 选择conectivity，里面可以看见一个连接表，点击取消那些在你的分子中不应该有的连接后，然后再点击“连接”。
3.现在你可以看见连接好的结构图。如要调整，重新做第2步。
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2楼2008-02-05 15:30:51
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linxiaoming

铁虫 (小有名气)
谢谢2楼的建议，可以行得通，但有个问题，之前我是每次打开就能建立几个完整的分子连接在一起的的，很好的，但现在怎么才能像以前那样直接打开就可以看到完整的分子的呢而不用每次打开就得修改的呢？你的方法应该每次都得在conectivity里修改的吧。
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3楼2008-02-05 16:42:21
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zilanyu

木虫 (正式写手)
楼主的情况我也碰到过，我是把diamond卸了后，又重新安装的就好了
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4楼2008-02-13 16:09:42
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狼外婆

金虫 (著名写手)
肯定是默认的那些设置改变了。不过我也不知道如何修改。
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5楼2008-02-14 10:44:23
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tjlicp

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
seasedoctor(金币+3,VIP+0):非常好的建议。
在上面菜单tools——reset settings，再OK即可。就可以回复出厂设置
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6楼2008-02-19 16:45:28
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nuser

金虫 (正式写手)
这个问题是因为你把缺省的键长改动了（有意或者无意），这些值是存储在注册表里面的。reset setting或者完全删除后重新安装都可以解决问题。
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7楼2008-02-19 17:05:05
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