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hongwuxu

至尊木虫 (著名写手)

[交流] 请教高手有关手性晶体绝对构型!

一个有机手性化合物晶体的cif拿去check的时候出现了A类问题:

PLAT035_ALERT_1_A No _chemical_absolute_configuration info given .          ?

但是这个化合物没有重原子,实际上绝对构型没法解决。

请高手帮忙解决一下,谢谢了!
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

化学合成和降解关联法
X-射线单晶衍射法(带重原子)
旋光比较法
旋光色散光谱法(ORD)法和圆二色谱(CD)法
红外CD法和红外振动Raman光谱法
NMR法

[ Last edited by yalefield on 2008-2-4 at 11:02 ]
2楼2008-02-04 10:57:51
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iphyaries

铁杆木虫 (小有名气)

没有重原子的话要用单晶衍射仪做绝对构型只能用Cu靶
目前在中国用Cu靶做小分子的很少
不过好像厂家已经开始推广一种双光源的单晶衍射仪
一个衍射仪上同时配上Mo靶和Cu靶
这样使用Cu靶就非常方便了,不需要换了光管后还要调光
Ineedlearnmore...
3楼2008-02-04 11:23:51
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hongwuxu

至尊木虫 (著名写手)

意思就是现在这套数据肯定解决不了绝对构型了?如果要将这套数据拿去发晶体学报类的文章这个A类问题也没有办法解决了?
谢谢两位!
4楼2008-02-04 18:52:12
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

个人认为:
如果您的这个有机化合物晶体有手性,那么您很幸运。但您的这个有机化合物晶体有手性,所以,您还要继续设法测出其手性信息。革命尚未成功,......仍需努力。
5楼2008-02-04 19:12:00
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gujm516

金虫 (小有名气)

如果你的结构中没有大于Si元素的原子,这个问题还是可以解决的。
只要在熔点这一行
_chemical_melting_point                ?
的后面加上一行

_chemical_absolute_configuration       ' unk '

就OK了。
6楼2008-02-05 00:32:54
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hongwuxu

至尊木虫 (著名写手)

谢谢大家了!祝新年快乐!
7楼2008-02-05 12:07:12
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jpzou

木虫 (正式写手)

在CIF文件中紧跟flack因子的下一行加“_chemical_absolute_configuration info given.             ad”,即可解决。
8楼2008-02-05 12:23:53
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