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zhuimeng08

银虫 (正式写手)

[求助] 在做gromacs教程跑膜的MD例子 ,老报错!求指教

我在做gromacs教程上的例子,http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... _protein/index.html
在做到 grompp -f minim.mdp -c dppc128.gro -p topol_dppc.top -o em.tpr这步时,
报Fatal error:Atomtype CA not found,所以把ffnonbond.itp中所有的CA、CB、CD项删去。但是这样一来,在做到
grompp -f ions.mdp -c system_solv.gro -p topol.top -o ions.tpr这步时,则报同样的错误,即Fatal error:Atomtype CA not found,
我便把原来ffnonbond.itp中所有的CA、CB、CD项再次加上,运行。依然报同样的错误,即Fatal error:Atomtype CA not found。
求指教

[ Last edited by zhuimeng08 on 2014-3-6 at 09:19 ]
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疯狂的鬼马

新虫 (初入文坛)

楼主楼主  你这个问题解决了吗 我呀出现了类似的问题 求指教啊
3楼2016-12-30 15:25:09
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贝叶竹青

木虫 (著名写手)

打扰您一下 ions.mdp文件是怎么来的啊
come to meet a different you.努力到无能为力,拼搏到感动自己。
2楼2015-05-28 22:04:08
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青青白白123

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 疯狂的鬼马 at 2016-12-30 15:25:09
楼主楼主  你这个问题解决了吗 我呀出现了类似的问题 求指教啊

你好,请问你的问题解决了吗?
4楼2018-03-21 14:25:13
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