应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 在做gromacs教程跑膜的MD例子 ，老报错！求指教
51/1返回列表
查看: 1235  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhuimeng08

银虫 (正式写手)

[求助] 在做gromacs教程跑膜的MD例子 ，老报错！求指教

我在做gromacs教程上的例子，http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... _protein/index.html
在做到 grompp -f minim.mdp -c dppc128.gro -p topol_dppc.top -o em.tpr这步时，
报Fatal error:Atomtype CA not found，所以把ffnonbond.itp中所有的CA、CB、CD项删去。但是这样一来，在做到
grompp -f ions.mdp -c system_solv.gro -p topol.top -o ions.tpr这步时，则报同样的错误，即Fatal error:Atomtype CA not found，
我便把原来ffnonbond.itp中所有的CA、CB、CD项再次加上，运行。依然报同样的错误，即Fatal error:Atomtype CA not found。
求指教

[ Last edited by zhuimeng08 on 2014-3-6 at 09:19 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2014-03-06 09:12:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

疯狂的鬼马

新虫 (初入文坛)
楼主楼主  你这个问题解决了吗 我呀出现了类似的问题 求指教啊
赞一下 回复此楼
3楼2016-12-30 15:25:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答

贝叶竹青

木虫 (著名写手)
打扰您一下 ions.mdp文件是怎么来的啊
赞一下 回复此楼
come to meet a different you.努力到无能为力，拼搏到感动自己。
2楼2015-05-28 22:04:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

青青白白123

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 疯狂的鬼马 at 2016-12-30 15:25:09
楼主楼主  你这个问题解决了吗 我呀出现了类似的问题 求指教啊

你好，请问你的问题解决了吗？
赞一下 回复此楼
4楼2018-03-21 14:25:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 4 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿武理材料工程348求调剂 +5 ￣^￣゜汗 2026-03-19 7/350 2026-03-22 19:44 by 公瑾逍遥
[考研] 306求调剂 +6 chuanzhu川烛 2026-03-18 6/300 2026-03-22 19:39 by 公瑾逍遥
[考研] 287求调剂 +8 晨昏线与星海 2026-03-19 9/450 2026-03-22 17:01 by i_cooler
[考研] 269专硕求调剂 +6 金恩贝 2026-03-21 6/300 2026-03-22 14:31 by ColorlessPI
[考研] 354求调剂 +7 Tyoumou 2026-03-18 10/500 2026-03-22 11:11 by 人来盛
[考研] 384求调剂 +3 子系博 2026-03-22 4/200 2026-03-22 11:04 by 搏击518
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
[考研] 0805 316求调剂 +3 大雪深藏 2026-03-18 3/150 2026-03-21 18:55 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +3 13341 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:28 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +6 Mqqqqqq 2026-03-19 6/300 2026-03-21 08:04 by JourneyLucky
[考研] 316求调剂 +6 梁茜雯 2026-03-19 6/300 2026-03-21 06:32 by Ecowxq666！
[考研] 307求调剂 +3 wyyyqx 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:20 by JourneyLucky
[考研] 083200学硕321分一志愿暨南大学求调剂 +3 innocenceF 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:35 by JourneyLucky
[考研] 274求调剂 +10 S.H1 2026-03-18 10/500 2026-03-20 23:51 by JourneyLucky
[考研] 321求调剂 +9 何润采123 2026-03-18 11/550 2026-03-20 23:19 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西安交通大学 学硕 354求调剂211或者双一流 +3 我想要读研究生 2026-03-20 3/150 2026-03-20 20:13 by JourneyLucky
[考研] 261求B区调剂，科研经历丰富 +3 牛奶很忙 2026-03-20 4/200 2026-03-20 19:34 by JourneyLucky
[考研] 一志愿南理工085701环境302求调剂院校 +3 葵梓卫队 2026-03-20 3/150 2026-03-20 19:28 by zhukairuo
[考研] 0856调剂，是学校就去 +8 sllhht 2026-03-19 9/450 2026-03-20 14:25 by 无懈可击111
[考研] 085600材料与化工调剂 324分 +10 llllkkkhh 2026-03-18 12/600 2026-03-19 14:33 by llllkkkhh
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭