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zhuimeng08银虫 (正式写手)
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[求助]
在做gromacs教程跑膜的MD例子 ,老报错!求指教
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我在做gromacs教程上的例子,http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... _protein/index.html 在做到 grompp -f minim.mdp -c dppc128.gro -p topol_dppc.top -o em.tpr这步时, 报Fatal error:Atomtype CA not found,所以把ffnonbond.itp中所有的CA、CB、CD项删去。但是这样一来,在做到 grompp -f ions.mdp -c system_solv.gro -p topol.top -o ions.tpr这步时,则报同样的错误,即Fatal error:Atomtype CA not found, 我便把原来ffnonbond.itp中所有的CA、CB、CD项再次加上,运行。依然报同样的错误,即Fatal error:Atomtype CA not found。 求指教 [ Last edited by zhuimeng08 on 2014-3-6 at 09:19 ] |
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