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jk射手座

新虫 (著名写手)

[求助] 用vasp脚本算极化强度,脚本出错,急死了 已有1人参与

本人在用脚本算材料的极化强度,脚本的编译时这样的:
#!/bin/bash
cp POSCAR1 POSCAR
/public/jzh/vasp5
cp OUTCAR OUTCAR1
cp POSCAR2 POSCAR
/public/jzh/vasp5
cp OUTCAR OUTCAR2
结果出现了错误,如下:
/pp:line 3: 14301 Segmentation fault      /public/jzh/vasp5
/pp: line 6: 14341 Segmentation fault      /public/jzh/vasp5
其中,pp是我脚本的名字,然后后边的路径是vasp的位置,它提示说错误的line3 和6,就是路径的那两行,我很搞不懂,我一共算8个晶格参数a,3.89~3.96的
为什么3.89和3.90的可以算,后边六个点死活就是算不了了呢。。。
实在不知道毛病出在哪儿了,应该改些什么东西,求求路过的大神指教啊
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主做电弧增材制造方向
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
fzx2008: 金币+3, 谢谢指导 2014-03-04 23:06:54
不是你的脚本出错。提示信息“14301 Segmentation fault      /public/jzh/vasp5”表明你的vasp模块有问题,出现最了典型的segmentation fault错误。可能你的计算体系比较大,或者是你的vasp5编译的有点问题。

用一个小体系来测试看你的vasp5模块能正常运行,对小体系都不能正常运行的话,那你需要在Makefile文件里设置合适的编译选择,重新编译一下。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2014-03-04 20:12:28
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jk射手座

新虫 (著名写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by valenhou001 at 2014-03-04 20:12:28
不是你的脚本出错。提示信息“14301 Segmentation fault      /public/jzh/vasp5”表明你的vasp模块有问题,出现最了典型的segmentation fault错误。可能你的计算体系比较大,或者是你的vasp5编译的有点问题。

用 ...

一语点醒梦中人呐!非常感谢侯老师!!
我现在算的这个应该就算大体系了,是PbTiO3/KTaO3超晶格材料,先前算的比例是1:1,1:2 和2:1的,也就是三层超晶格,那时候还没有提醒,到了这个2:2的四层,以及之前也算过的4:1五层的,都会有如下提示:
“ADVICE TO THIS USER RUNNING 'VASP/VAMP'   (HEAR YOUR MASTER'S VOICE ...):  |
|                                                                             |
|      You have a (more or less) 'large supercell' and for larger cells       |
|      it might be more efficient to use real space projection opertators     |
|      So try LREAL= Auto  in the INCAR   file.                               |
|      Mind: At the moment your POTCAR file does not contain real space       |
|       projectors, and has to be modified,  BUT if you                       |
|      want to do an extremely  accurate calculation you might also keep the  |
|      reciprocal projection scheme          (i.e. LREAL=.FALSE.) ”

这里我就两个没明白,一个是那个LREAL我设置过,但是反而算不了了,不知道这个参数设置的时候还有其他注意的什么事项;第二是它说我的 POTCAR file does not contain real space ,这个是要我换掉POTCAR的类型吗?
当然,如果说编译确实出了问题,那很多问题估计也是因为编译引起的,我用的vasp是通过SSH链接学院的服务器进行计算的,是上上届的师兄编译的,具体我也不知道他怎么编译的,总之看来要麻烦一些了
主做电弧增材制造方向
3楼2014-03-05 08:37:16
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jk射手座 at 2014-03-05 09:37:16
一语点醒梦中人呐!非常感谢侯老师!!
我现在算的这个应该就算大体系了,是PbTiO3/KTaO3超晶格材料,先前算的比例是1:1,1:2 和2:1的,也就是三层超晶格,那时候还没有提醒,到了这个2:2的四层,以及之前也 ...

“第二是它说我的 POTCAR file does not contain real space ,这个是要我换掉POTCAR的类型吗?”不用换赝势。
4楼2014-03-05 08:51:56
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jk射手座

新虫 (著名写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by valenhou001 at 2014-03-05 08:51:56
“第二是它说我的 POTCAR file does not contain real space ,这个是要我换掉POTCAR的类型吗?”不用换赝势。...

那请问老师,出现这样的提示会影响到计算结果的可靠性吗,还是不用管它能够进行计算就可以,因为以后还有五层一周期的结构要算,那样体系更大了。实在不好意思,这个问题我看vasp的英文手册也没找到满意的答案,谢谢侯老师了!
主做电弧增材制造方向
5楼2014-03-05 09:06:18
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valenhou001

至尊木虫 (职业作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by jk射手座 at 2014-03-05 10:06:18
那请问老师,出现这样的提示会影响到计算结果的可靠性吗,还是不用管它能够进行计算就可以,因为以后还有五层一周期的结构要算,那样体系更大了。实在不好意思,这个问题我看vasp的英文手册也没找到满意的答案,谢 ...

如果要让结果更精确就设置LREAL=.FALSE.,但是这会增加计算量。不会特别影响计算结果的可靠性,可以不用管它,除非在所要考虑的问题的精度要求特别高(比如能量差在meV量级左右)。
6楼2014-03-05 09:55:33
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jk射手座

新虫 (著名写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by valenhou001 at 2014-03-05 09:55:33
如果要让结果更精确就设置LREAL=.FALSE.,但是这会增加计算量。不会特别影响计算结果的可靠性,可以不用管它,除非在所要考虑的问题的精度要求特别高(比如能量差在meV量级左右)。...

侯老师,太感谢了,现在知道了!
主做电弧增材制造方向
7楼2014-03-05 10:53:27
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