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胡博洋的洋

金虫 (小有名气)

[求助] DL_POLY_4的CONFIG文件中原子未定义错误求助 已有1人参与

各位前辈们好,我最近在用DL_POLY_4中遇到了如下问题:
---------------------------------------------------------------------------------
unidentified atom label :Li      : atom number     2

unidentified atom label :Li      : atom number     3

unidentified atom label :Li      : atom number     4

unidentified atom label :O       : atom number     6

unidentified atom label :O       : atom number     7

·······
unidentified atom label :Li      : atom number   200
DL_POLY_4 terminated due to error    25
error - wrong atom type found in CONFIG file
--------------------------------------------------------------------------------
但是很明显我的CONFIG文件中定义了原子类型并且也和FIELD中的对应,并且也修改了他们之间的空格数,为什么还会出现这样的错误呢?
我在网上查了很多相关的错误,但是均没有得到解决。我又根据下载的例子来对比我的CONFIG文件,最后修改完也仍是这样报错,请问这是什么原因吗?希望各位大神帮我解答下,万分感谢!
我的部分CONFIG文件如下:
---------------------------------------------------------------------------
LIFEPO4 + shells (444 1792 cores 1280 shell)
          0         3      3072
        41.8027000427        0.0000000000        0.0000000000
         0.0000000000       24.3493995667        0.0000000000
         0.0000000000        0.0000000000       19.0077991486
Li               1
    -20.901350021       -12.174699783        -9.503899574
Li               2
    -15.676012516        -9.131024837        -7.127924681
Li               3
    -15.676012516       -12.174699783        -7.127924681
Li               4
    -20.901350021        -9.131024837        -9.503899574
O                5
    -19.891396807       -10.652862310        -5.975291602
O                6
    -12.181306811        -8.843701776        -6.111767701
O                7
    -12.181306811        -6.374672953        -6.111767701
O                8
    -11.460628148        -7.609187365        -8.280557617
O                9
    -20.454897172        -7.609187365        -6.148262670
O               10
    -16.685965653        -7.609187365        -8.351266638
O               11
    -19.170718221       -11.887376858        -8.144081660
·················
Fe_S          3069
     18.618922583         7.609187365         7.240450717
Fe_S          3070
     17.958439954        10.652862310         4.864475824
Fe_S          3071
     13.393585078         7.609187365         9.391373538
Fe_S          3072
     12.733102449        10.652862310         7.015398644
--------------------------------------------------------------------------
我的FIELD文件如下:
---------------------------------------------------------------------------
Shell Model LiFePO4 PNMA
units eV
molecular types 1
LiFePO4
nummols 256
atoms 12
Li            6.9380        1.00    1    0    1
O            15.7994        0.96    4    0    1
Os            0.2000       -2.96    4    0    1
P            30.9740        5.00    1    0    1
Fe           55.6450      -0.986    1    0    1
Fe_S          0.2000       2.986    1    0    1
shell 5 2
     2    6     65.0
     3    7     65.0
     4    8     65.0
     5    9     65.0
    11   12    19.27
finish
vdw 4
Li    Os  buck   632.1018    0.2906     0.000
Fe_S  Os  buck  1105.2409    0.3106     0.000
P     Os  buck   897.2648    0.3577     0.000
Os    Os  buck    22764.3     0.149     44.53
close
----------------------------------------------------------------------
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tianlangxingaa

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感谢参与,应助指数 +1
胡博洋的洋: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢谢谢,不过我看例子中的并没有按照那样制定的顺序来写的啊,不过我去试试 2014-03-03 09:08:34
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-03 20:09:38
FIELD中定义为
Li            6.9380        1.00    1    0    1
O            15.7994        0.96    4    0    1
Os            0.2000       -2.96    4    0    1
P            30.9740        5.00    1    0    1
Fe           55.6450      -0.986    1    0    1
Fe_S          0.2000       2.986    1    0    1
说明第一个是Li,第2-5个是O,第6-9是Os。
而你的CONFIG文件,第1-4个是Li,第5-11是O。

第一个都是Li,没问题
第2-4个本应该是O,但config是Li,所以错误
第5个是O,所以又没问题。。。。。
2楼2014-03-02 21:51:13
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