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胡博洋的洋

金虫 (小有名气)

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[求助] DL_POLY_4的CONFIG文件中原子未定义错误求助已有1人参与

各位前辈们好，我最近在用DL_POLY_4中遇到了如下问题：
---------------------------------------------------------------------------------
unidentified atom label :Li    : atom number    2

unidentified atom label :Li    : atom number    3

unidentified atom label :Li    : atom number    4

unidentified atom label :O    : atom number    6

unidentified atom label :O    : atom number    7

·······
unidentified atom label :Li    : atom number 200
DL_POLY_4 terminated due to error 25
error - wrong atom type found in CONFIG file
--------------------------------------------------------------------------------
但是很明显我的CONFIG文件中定义了原子类型并且也和FIELD中的对应，并且也修改了他们之间的空格数，为什么还会出现这样的错误呢？
我在网上查了很多相关的错误，但是均没有得到解决。我又根据下载的例子来对比我的CONFIG文件，最后修改完也仍是这样报错，请问这是什么原因吗？希望各位大神帮我解答下，万分感谢！
我的部分CONFIG文件如下：
---------------------------------------------------------------------------
LIFEPO4 + shells (444 1792 cores 1280 shell)
      0       3    3072
      41.8027000427       0.0000000000       0.0000000000
      0.0000000000    24.3493995667       0.0000000000
      0.0000000000       0.0000000000    19.0077991486
Li             1
-20.901350021    -12.174699783       -9.503899574
Li             2
-15.676012516       -9.131024837       -7.127924681
Li             3
-15.676012516    -12.174699783       -7.127924681
Li             4
-20.901350021       -9.131024837       -9.503899574
O             5
-19.891396807    -10.652862310       -5.975291602
O             6
-12.181306811       -8.843701776       -6.111767701
O             7
-12.181306811       -6.374672953       -6.111767701
O             8
-11.460628148       -7.609187365       -8.280557617
O             9
-20.454897172       -7.609187365       -6.148262670
O             10
-16.685965653       -7.609187365       -8.351266638
O             11
-19.170718221    -11.887376858       -8.144081660
·················
Fe_S       3069
   18.618922583       7.609187365       7.240450717
Fe_S       3070
   17.958439954       10.652862310       4.864475824
Fe_S       3071
   13.393585078       7.609187365       9.391373538
Fe_S       3072
   12.733102449       10.652862310       7.015398644
--------------------------------------------------------------------------
我的FIELD文件如下：
---------------------------------------------------------------------------
Shell Model LiFePO4 PNMA
units eV
molecular types 1
LiFePO4
nummols 256
atoms 12
Li          6.9380       1.00 1 0 1
O          15.7994       0.96 4 0 1
Os          0.2000    -2.96 4 0 1
P          30.9740       5.00 1 0 1
Fe          55.6450    -0.986 1 0 1
Fe_S       0.2000    2.986 1 0 1
shell 5 2
   2 6    65.0
   3 7    65.0
   4 8    65.0
   5 9    65.0
11 12 19.27
finish
vdw 4
Li Os  buck 632.1018 0.2906    0.000
Fe_S  Os  buck  1105.2409 0.3106    0.000
P    Os  buck 897.2648 0.3577    0.000
Os Os  buck 22764.3    0.149    44.53
close
----------------------------------------------------------------------

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不得求之

1楼 2014-02-28 09:50:55

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

tianlangxingaa

铁杆木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
胡博洋的洋: 金币+20, ★★★很有帮助, 谢谢谢谢，不过我看例子中的并没有按照那样制定的顺序来写的啊，不过我去试试 2014-03-03 09:08:34
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-03-03 20:09:38

FIELD中定义为
Li          6.9380       1.00 1 0 1
O          15.7994       0.96 4 0 1
Os          0.2000    -2.96 4 0 1
P          30.9740       5.00 1 0 1
Fe          55.6450    -0.986 1 0 1
Fe_S       0.2000    2.986 1 0 1
说明第一个是Li，第2-5个是O，第6-9是Os。
而你的CONFIG文件，第1-4个是Li，第5-11是O。

第一个都是Li，没问题
第2-4个本应该是O，但config是Li，所以错误
第5个是O，所以又没问题。。。。。

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