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怎样进行高斯输入文件的设置 用于计算Wiberg Bond Indices
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我在进行一个关于元素Am的配位化学的计算，想要仿照一篇文章进行Am和配体上四个芳香氮原子形成的M-N配位键的Wiberg Bond Indices的计算（配体的结构在文件L-A.jpg中，文章是参照ic400895d.pdf的第3-5页，还有我想仿照这篇文章，进行the Mulliken orbital population occupancy of the valence s, p, d, f shells and natural population analysis (NPA)），我对优化后的结构在gaussview上进行了输入设置后，在大计算机的gaussian 09上进行了计算，10分钟左右后输出了结果，但我看不懂应该截取哪一部分，抑或是我输入的有错，希望大家帮助我纠正一下，写几个输入文件，帮我实现以上几个计算功能。我自己原来写的输入文件是2Am-B_opt_NBO_1.gjf，大计算机的输出文件是2Am-B_opt_NBO_1.out。 b3lyp/genecp L-A.jpg |
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- 附件 2 : ic400895d.pdf
2014-02-27 15:48:44, 725.98 K
2014-02-27 15:52:55, 1.41 M
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补充一句，这是我自己的输入文件： %chk=[AmL-A]3+_1.chk %mem=2000MW %nprocshare=12 #p b3lyp/genecp pop=nbo geom=connectivity scf=maxcyc=2500 [AmL-A]3+_1 3 1 C 0.00000000 4.46275500 -2.74871600 C -1.20994500 3.96283300 -2.25238500 C -1.16208300 2.94457200 -1.30311700 N 0.00000000 2.39875600 -0.87608300 C 1.16208300 2.94457200 -1.30311700 C 1.20994500 3.96283300 -2.25238500 C -2.35842800 2.32094500 -0.63895500 N -2.16922300 2.22131600 0.79276200 C -2.87028900 1.17154700 1.43678100 C -4.00987500 1.22194300 2.22478800 C -4.55495300 0.00000000 2.64894600 C -4.00987500 -1.22194300 2.22478800 C -2.87028900 -1.17154700 1.43678100 N -2.27337600 0.00000000 1.13494000 O -3.27254000 1.79896500 -1.22212200 N -2.16922300 -2.22131600 0.79276200 C -2.35842800 -2.32094500 -0.63895500 C -1.16208300 -2.94457200 -1.30311700 N 0.00000000 -2.39875600 -0.87608300 C 1.16208300 -2.94457200 -1.30311700 C 1.20994500 -3.96283300 -2.25238500 C 0.00000000 -4.46275500 -2.74871600 C -1.20994500 -3.96283300 -2.25238500 O -3.27254000 -1.79896500 -1.22212200 C 2.35842800 -2.32094500 -0.63895500 N 2.16922300 -2.22131600 0.79276200 C 2.87028900 -1.17154700 1.43678100 C 4.00987500 -1.22194300 2.22478800 C 4.55495300 0.00000000 2.64894600 C 4.00987500 1.22194300 2.22478800 C 2.87028900 1.17154700 1.43678100 N 2.27337600 0.00000000 1.13494000 O 3.27254000 -1.79896500 -1.22212200 N 2.16922300 2.22131600 0.79276200 C 2.35842800 2.32094500 -0.63895500 O 3.27254000 1.79896500 -1.22212200 H 0.00000000 5.25415000 -3.49252800 H -2.16524400 4.36114000 -2.57985600 H 2.16524400 4.36114000 -2.57985600 H -4.48467100 2.16546600 2.47251900 H -5.45378500 0.00000000 3.25877100 H -4.48467100 -2.16546600 2.47251900 H 2.16524400 -4.36114000 -2.57985600 H 0.00000000 -5.25415000 -3.49252800 H -2.16524400 -4.36114000 -2.57985600 H 4.48467100 -2.16546600 2.47251900 H 5.45378500 0.00000000 3.25877100 H 4.48467100 2.16546600 2.47251900 Am 0.00000000 0.00000000 0.24230300 H -2.04216200 3.10285000 1.28780700 H -2.04216200 -3.10285000 1.28780700 H 2.04216200 -3.10285000 1.28780700 H 2.04216200 3.10285000 1.28780700 1 2 1.5 6 1.5 37 1.0 2 3 1.5 38 1.0 3 4 1.5 7 1.0 4 5 1.5 5 6 1.5 35 1.0 6 39 1.0 7 8 1.0 15 2.0 8 9 1.0 50 1.0 9 10 1.5 14 1.5 10 11 1.5 40 1.0 11 12 1.5 41 1.0 12 13 1.5 42 1.0 13 14 1.5 16 1.0 14 15 16 17 1.0 51 1.0 17 18 1.0 24 2.0 18 19 1.5 23 1.5 19 20 1.5 20 21 1.5 25 1.0 21 22 1.5 43 1.0 22 23 1.5 44 1.0 23 45 1.0 24 25 26 1.0 33 2.0 26 27 1.0 52 1.0 27 28 1.5 32 1.5 28 29 1.5 46 1.0 29 30 1.5 47 1.0 30 31 1.5 48 1.0 31 32 1.5 34 1.0 32 33 34 35 1.0 53 1.0 35 36 2.0 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 C O N H 0 6-31G(d) **** Am 0 S 3 1.00 14084.9880000 0.000051 2046.0599000 0.000352 429.7082900 0.001329 S 1 1.00 118.2852400 1.0 S 3 1.00 68.9603430 0.048888 40.3868660 -0.258379 23.5354640 0.799159 S 1 1.00 11.8054890 1.0 S 1 1.00 3.2750700 1.0 S 1 1.00 1.7486870 1.0 S 1 1.00 0.7133150 1.0 S 1 1.00 0.3186590 1.0 S 1 1.00 0.0626800 1.0 S 1 1.00 0.0253000 1.0 P 5 1.00 3013.9867000 0.000171 707.5494600 0.001442 225.1384400 0.006705 81.2568110 0.019212 25.7390950 0.037645 P 1 1.00 15.0434860 1.0 P 1 1.00 8.7825570 1.0 P 1 1.00 3.8113000 1.0 P 1 1.00 1.8941590 1.0 P 1 1.00 0.7249960 1.0 P 1 1.00 0.3068650 1.0 P 1 1.00 0.1056290 1.0 P 1 1.00 0.0315700 1.0 D 6 1.00 484.3387700 0.000103 149.1364600 0.000762 62.2431320 0.002951 23.5886520 0.016120 10.0544880 -0.072397 4.2667540 0.416178 D 1 1.00 2.1143870 1.0 D 1 1.00 0.9358470 1.0 D 1 1.00 0.2794940 1.0 D 1 1.00 0.0831310 1.0 F 5 1.00 127.6836500 0.000350 43.6865510 0.003511 17.6537490 0.018352 6.6009260 0.104824 3.1971760 0.330143 F 1 1.00 1.4594050 1.0 F 1 1.00 0.6076560 1.0 F 1 1.00 0.2178980 1.0 G 4 1.00 127.6836500 -0.000026 43.6865510 0.005016 17.6537490 0.030211 6.6009260 0.166814 G 1 1.00 3.1971760 1.0 G 1 1.00 1.4594050 1.0 **** Am 0 AM-ECP 5 60 h-ul potential 1 2 1.000000000 0.000000000 s-ul potential 1 2 19.130096480 672.426908480 p-ul potential 1 2 9.559142070 180.983630040 d-ul potential 1 2 9.161266170 139.037563890 f-ul potential 1 2 7.035754630 51.273553140 g-ul potential 1 2 14.681332890 -67.616942080 |
2楼2014-02-27 15:57:13
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