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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » lammps怎么运用rerun命令计算截断距离之外的rdf
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心转角

新虫 (初入文坛)

[求助] lammps怎么运用rerun命令计算截断距离之外的rdf 已有1人参与

用compute rdf命令只能计算截断距离之内的g(r)曲线，lammps手册上说可以用rerun命令得到截断距离之外的rdf。我想把g(r)曲线的横坐标值范围大一些，大家有用过rerun命令吗？该如何用？请求帮助！！！
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1楼 2014-02-25 21:32:25
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QQ_Q_Q_QQ

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-26 11:22:30
以下只是个人猜测，不保证管用：

既然是rerun，那么应该只是读入原来已经算好的轨迹文件而不重新计算了，那么是否可以rerun的时候把 cut-off 增大（这个增大应该不改变轨迹），然后再计算rdf?
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2楼2014-02-26 09:40:32
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心转角

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by QQ_Q_Q_QQ at 2014-02-26 09:40:32
以下只是个人猜测，不保证管用：

既然是rerun，那么应该只是读入原来已经算好的轨迹文件而不重新计算了，那么是否可以rerun的时候把 cut-off 增大（这个增大应该不改变轨迹），然后再计算rdf?

是在run之后直接rerun，还是重新编写程序直接rerun？
读取的dump文件是包括坐标的文件，还是run出来的包含rdf的文件？
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

无穷晓亮
3楼2014-02-26 15:06:18
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刘晓菲123

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 心转角 at 2014-02-26 15:06:18
是在run之后直接rerun，还是重新编写程序直接rerun？
读取的dump文件是包括坐标的文件，还是run出来的包含rdf的文件？...

您好，大神，我想问下compute rdf 这条命令怎么写，看手册还是很模糊，我要用于二元合金，举个例子也行。尤其不懂手册上的Ntype、jtype指什么，谢谢
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4楼2016-09-01 15:00:08
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无穷晓亮

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 心转角 at 2014-02-26 15:06:18
是在run之后直接rerun，还是重新编写程序直接rerun？
读取的dump文件是包括坐标的文件，还是run出来的包含rdf的文件？...

楼主的问题解决了吗？我也有同样的问题(O_O)，可以回复一下吗？

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5楼2017-03-29 07:49:38
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liuleixmc

新虫 (小有名气)
请问楼主你的问题解决了吗，我也想计算截断半径之外的rdf值，我的材料是晶体。

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6楼2018-05-22 11:40:56
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