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心转角

新虫 (初入文坛)

[求助] lammps怎么运用rerun命令计算截断距离之外的rdf 已有1人参与

用compute rdf命令只能计算截断距离之内的g(r)曲线,lammps手册上说可以用rerun命令得到截断距离之外的rdf。我想把g(r)曲线的横坐标值范围大一些,大家有用过rerun命令吗?该如何用?请求帮助!!!
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QQ_Q_Q_QQ

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-26 11:22:30
以下只是个人猜测,不保证管用:

既然是rerun,那么应该只是读入原来已经算好的轨迹文件而不重新计算了,那么是否可以rerun的时候把 cut-off 增大(这个增大应该不改变轨迹),然后再计算rdf?
2楼2014-02-26 09:40:32
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心转角

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by QQ_Q_Q_QQ at 2014-02-26 09:40:32
以下只是个人猜测,不保证管用:

既然是rerun,那么应该只是读入原来已经算好的轨迹文件而不重新计算了,那么是否可以rerun的时候把 cut-off 增大(这个增大应该不改变轨迹),然后再计算rdf?

是在run之后直接rerun,还是重新编写程序直接rerun?
读取的dump文件是包括坐标的文件,还是run出来的包含rdf的文件?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

3楼2014-02-26 15:06:18
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刘晓菲123

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 心转角 at 2014-02-26 15:06:18
是在run之后直接rerun,还是重新编写程序直接rerun?
读取的dump文件是包括坐标的文件,还是run出来的包含rdf的文件?...

您好,大神,我想问下compute rdf 这条命令怎么写,看手册还是很模糊,我要用于二元合金,举个例子也行。尤其不懂手册上的Ntype、jtype指什么,谢谢
4楼2016-09-01 15:00:08
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无穷晓亮

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by 心转角 at 2014-02-26 15:06:18
是在run之后直接rerun,还是重新编写程序直接rerun?
读取的dump文件是包括坐标的文件,还是run出来的包含rdf的文件?...

楼主的问题解决了吗?我也有同样的问题(O_O),可以回复一下吗?

发自小木虫Android客户端
5楼2017-03-29 07:49:38
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liuleixmc

新虫 (小有名气)

请问楼主你的问题解决了吗,我也想计算截断半径之外的rdf值,我的材料是晶体。

发自小木虫Android客户端
6楼2018-05-22 11:40:56
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