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liuchenhan新虫 (小有名气)
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[求助]
关于石墨加压的lammps模拟
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小弟希望做lammps加压下石墨晶格常数的变化。 要求：c-axis 方向加1GPa，面内不加压，自由变化，温度要设在300K.以下是我的脚本。 # simulation # Initialization variable dt equal 0.0005 variable Tstart equal 1000.0 variable Tstop equal 300.0 variable Tdamp equal 100.0*${dt} variable Pstart equal 10.0 variable Pstop equal 10.0 variable Pdamp equal 1000.0*${dt} units metal dimension 3 newton on boundary p p p atom_style atomic neighbor 0.3 nsq neigh_modify check yes read_data nanonew.xyz # tersoff pair_style hybrid tersoff lj/cut 8.5 pair_coeff * * tersoff Cnew.tersoff C C C C C C C C pair_coeff 1 2 lj/cut 0.0024 3.4 #8.5 3.4 pair_coeff 1 3 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 1 4 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 1 5 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 1 6 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 1 7 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 1 8 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 2 3 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 2 4 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 2 5 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 2 6 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 2 7 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 2 8 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 3 4 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 3 5 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 3 6 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 3 7 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 3 8 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 4 5 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 4 6 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 4 7 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 4 8 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 5 6 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 5 7 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 5 8 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 6 7 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 6 8 lj/cut 0.0024 3.4 pair_coeff 7 8 lj/cut 0.0024 3.4 velocity all create ${Tstart} 1000001 mom yes rot yes dist gaussian fix NPT all npt temp ${Tstart} ${Tstop} ${Tdamp} x 10.0 10.0 1000.0*${dt} y 10.0 10.0 1000.0*${dt} z 1000.0 1000.0 1000.0*${dt} variable V equal vol variable LX equal lx variable LY equal ly variable LZ equal lz variable T equal temp variable PE equal pe variable E equal etotal fix VOL all print 100 "$V ${LX} ${LY} ${LZ}" file volume.txt screen no fix TE all print 100 "$T ${PE} $E" file TE.txt screen no run 1000000 问题：1、周期性边界条件加的对不对，不对的话应该怎么改; 2、压强加的对不对，不对的话应该怎么改；加压强时需要周期性边界条件吗？ 3、脚本还有哪些错误的地方，麻烦指出 非常感谢大神能为小弟指点迷津，刚刚入门，还望海涵，拜托啦。 |
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liuchenhan
新虫 (小有名气)
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2楼2014-02-25 17:38:48
