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shjwu

新虫 (初入文坛)

[交流] 生物背景的人,学习分子模拟需要补充什么知识? 已有4人参与

我学生物出身,主要做微生物天然产物和生物转化等方面的研究。出于对生物分子模拟的兴趣和对研究工作的一些设想,一直想学习生物分子模拟。但我们学校没有人懂这个,找不到人教。目前利用在国外访学的机会,旁听了一门分子模拟的课。因为这门课是选修课,听的人不多,内容也比较杂,介绍不是很深入,并且由于语言等方面的原因,还在似懂非懂之间徘徊。不过好处是老师提供了MOE等软件供练习,自己也在利用空余时间自学gromacs等软件。但是越是学习,越发现自己懂的太少,很多东西都是知其然不知其所以然,即便会软件操作,也纯粹是依葫芦画瓢,自己的理解并不深刻。
        所以想问问各位大侠,像我这样学生物出身,要想更好地理解生物分子模拟,还应该补充哪些物理、化学和数学知识?有没有人介绍一些入门级的关于分子模拟理论(主要是理论,软件操作我可以自己摸索)方面的教材或书籍?
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jiangyunying

铜虫 (初入文坛)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-02-20 21:54:33
材料计算学  统计力学
4楼2014-02-20 16:32:31
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yalefield

金虫 (文坛精英)

老汉一枚

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
月只蓝: 金币+5, 感谢指导! 2014-02-20 11:06:45
月只蓝: 金币+1, 应助指数+1, 专家考核 2014-02-20 11:07:04
(1) 英国人A. R. Leach
Molecular Modelling ---- Principle and Applications.
十年前俺指点学生物的一个印度人和一个美国人看这本书(当时是第一版),现在伦家一个是印度国家实验室的中层,一个是美国某制药公司的中层。

(2) 德国人J. Gasteiger
Chemoinformatics ---- A Textbook
这相当于他搞的一套“大全”的一个导读。国内有中文版,翻译得比较仓促。

(3) 范波涛等,英文的Computer Chemistry and Molecular Design。高等教育出版社。

(4) 中文,北大徐筱杰(还有小超人侯廷军)的《计算机辅助药物分子设计》,内容比较全。

(5) 后来,魏冬青等写了《分子模拟与计算机辅助药物分子设计》。

建议:先浏览(4)和(5)。然后看(1)和(2)。最后看(3)。
2楼2014-02-20 09:42:34
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好好学习444

银虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
计算机编程语言,gromacs要学c++,批处理脚本用学perl语言
说好努力的
5楼2015-06-04 13:27:01
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