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tiechong

金虫 (著名写手)

[交流] Molpro内存不足 已有9人参与

比如每个核有2GB的内存,我用了"memory,192,m",按照Molpro的说明,是每个核用了192MW=1.5GB内存,可是每次都任务终止,提示"insufficient memory available - require 110715156  have  80466536",难道是说我只有80MW=640MB内存?
于是我就增加核的个数,用64个,128个总行吧?每个核1.5G, 我64个核96G内存了。可是还是同样的错误信息。
于是我就问Molpro,人家答复说:内存的需求不是所有核的累计,不管你用1个核还是100个核,每个核所需要的内存都是一样的。难道我得增加单个核的内存?可是俺们这每个核却只有2GB的内存啊(已经设了1.5GB了)

用过Molpro的虫子出来说说。难道算Molpro的单核都必须有远大于2GB的内存?比如全部是5GB甚至10GB一个核?

我也就是算算CASPT2(5,5),20个原子,一个过渡金属原子,没有对称性

[ Last edited by tiechong on 2014-2-17 at 06:55 ]
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
17楼: Originally posted by tiechong at 2014-02-20 13:17:34
俺不是专业做理论的,外行了.看来是说每个node有8个cpu和16G内存的话,用一个cpu也可以用16G内存了...

是的,一个cpu用64G内存我都干过...

要注意的是:在molpro里,你如果指定n个cpu并行的话,那么实际上会有1个cpu做为“主管”是不占用内存的,其他(n-1)个cpu做为“苦力”才占用内存。除非你只用了1个cpu。这一点可以在molpro任务运行时用top命令看到。

所以总的使用内存其实是(n-1)个cpu乘上你input file里的指定内存。
19楼2014-02-20 16:41:43
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查看全部 23 个回答

qchem

铁杆木虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
请molpro是怎么购买的,多少钱?
这个计算实际需要多少内存呢?像Gaussian是可以估算的
2楼2014-02-17 10:12:19
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kent1022

金虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也是一样的问题,不是设小了就是大了
3楼2014-02-17 15:51:57
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
楼主列一下机器的配置,总共有多少个cpu,多少内存...
另外列一下输入molpro运算时的命令,以及top命令下看到用了几个cpu...
4楼2014-02-17 17:38:18
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