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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 其他 » GOLD 5.0 对接
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Dreamalpen

银虫 (小有名气)

[求助] GOLD 5.0 对接 已有1人参与

GOLD5.0 对接，总是出现

Warning message:
Could not match reference and pose; RMS is likely not ok!

对接结果中有一项，RMS(heavy)  6.228 ，是不是这个对接结果是无效的啊？

对接过程中一定需要选择参考分子吗？
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2010年10月13日，美国费城，一名男子在晨曦中前行
1楼 2014-02-13 16:33:44
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zhanglu33

铜虫 (小有名气)
参考分子得是晶体复合物里的配体，并且你放进去对接的分子和该晶体复合物配体一致，这样算出来的RMS值才有意义。也就是用晶体复位的方式来衡量对接准确性的时候需要用这个参考分子。
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4楼2016-12-17 15:18:26
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-14 15:01:12
Dreamalpen: 金币+5, ★有帮助 2014-02-18 11:39:24
本帖内容被屏蔽
2楼2014-02-13 20:41:57
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aixintian

金虫 (著名写手)
求助gold软件。谢谢
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人生是个解不开的迷
3楼2015-04-08 13:02:03
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