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lybio

金虫 (正式写手)

[交流] 不需要加入引物进行PCR的问题

分别用两对引物扩增出两条目的DNA片断,这两条链5端和3端有20个互补碱基。现在以扩增出的这两条DNA链,互为模板和引物,不需要另加引物,扩增一段长的链。想请教有经验的人,反应体系一般是怎样的?谢谢!
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lybio

金虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by lihegang2000 at 2008-1-19 18:57:
1.应该叫重叠延伸PCR!我做过,但是我加了一对侧翼引物,这样才能扩增啊,不然怎么叫PCR呢,只能叫重叠延伸。
2.请问你这两个片段是回收后再混合进行PCR的吗?原则上要求两个片段的摩尔数相等。
3.但是你打算完 ...

两条DNA片断是回收后再混合一起,让它们重叠延伸的(没有P出来,可能是因为量太少,检测不出。再加P1,P4到延伸后的管中,继续PCR,但还是没条带)。对于摩尔数的要求,我是选电泳跑出条带亮度基本相同的两条。
8楼2008-01-21 16:51:27
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weiwei1

木虫 (小有名气)


reasonspare(金币+1,VIP+0):楼主又发问了.请你再辛苦一下.
你是说,两条片段完全互补,要变成一条双链DNA,是吗?
直接把两条片段混合,放在PCR仪内,95度5分钟,然后关掉PCR仪,过夜即可。
需要配退火缓冲液。
2楼2008-01-18 18:40:59
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lybio

金虫 (正式写手)

不是,这两条链分别有900KB和1000K,而且是已经扩增出来的双链。其中一条链(由引物P1和P2扩增)的5‘末端和另一条链(由引物P3和P4扩增)3’末端有20个碱基互补(因为P2和P3是互补的两条引物),现在就想在25UL体系里加入这两条链,taq酶,底物等,而不加其他引物来扩增长的为1900KB(900+1000)的DNA链,想知道反应体系一般是怎样的?
3楼2008-01-18 23:32:26
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skkyy88888

铜虫 (著名写手)

这种PCR叫什么呢?我还没听过,但比较有意思,而我有点怀疑可行性。退火的时候两条只有20BP的链会结合吗?与自身的互补链结合不是更有优势吗?
4楼2008-01-19 11:44:17
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