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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 综合其他 » The type strain is SJ4T (=DSM 22704T = JCM 16185T).
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hb魏静

金虫 (小有名气)

[求助] The type strain is SJ4T (=DSM 22704T = JCM 16185T). 已有1人参与

今天看文献的时候遇到这句话The type strain is SJ4T (=DSM 22704T = JCM 16185T)。请问这是什么意思啊？
还有我看到菌种的命名有的是Desulfosporosinus acidiphilus sp. nov.，有的是 Desulfosporosinus orientis DSM 765T，这是为什么啊？本人没有微生物学基础，还请高人指教，O(∩_∩)O~
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1楼 2014-02-07 14:18:16
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hb魏静

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaozhibozhi at 2014-02-07 15:34:45
第一句是说模式菌株是SJ4T.SJ4T是菌株号，括号内是该菌株在不同保藏机构内的菌株名称。

Desulfosporosinus acidiphilus sp. nov.是作者鉴定了一个新种，初次发表时对于该新种进行命名。
Desulfosporosinus orie ...

呃，我又想起来一个问题，如何鉴定一个新菌种呢？为什么我看到有人用16SDNA，DNA-DNA杂交技术和生理学、形态学分析以后确定自己筛选出来的是新菌种，然后还有人对该菌种进行基因组测序呢？全测序是有必要的吗？
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4楼2014-02-07 16:03:58
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
hb魏静: 金币+10, 解释的非常清楚明白 2014-02-07 15:50:55
第一句是说模式菌株是SJ4T.SJ4T是菌株号，括号内是该菌株在不同保藏机构内的菌株名称。

Desulfosporosinus acidiphilus sp. nov.是作者鉴定了一个新种，初次发表时对于该新种进行命名。
Desulfosporosinus orientis DSM 765T，Desulfosporosinus orientis是属名+种加词，即种名； DSM 765T是菌株名称。
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做一个阳光、开朗的小和尚
2楼2014-02-07 15:34:45
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hb魏静

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaozhibozhi at 2014-02-07 15:34:45
第一句是说模式菌株是SJ4T.SJ4T是菌株号，括号内是该菌株在不同保藏机构内的菌株名称。

Desulfosporosinus acidiphilus sp. nov.是作者鉴定了一个新种，初次发表时对于该新种进行命名。
Desulfosporosinus orie ...

哦，原来是这样，非常感谢O(∩_∩)O~金币都给你了
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3楼2014-02-07 15:50:58
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by hb魏静 at 2014-02-07 16:03:58
呃，我又想起来一个问题，如何鉴定一个新菌种呢？为什么我看到有人用16SDNA，DNA-DNA杂交技术和生理学、形态学分析以后确定自己筛选出来的是新菌种，然后还有人对该菌种进行基因组测序呢？全测序是有必要的吗？...

对于细菌，一般结合形态理化特征、几种分子特征，以及DNA-DNA杂交基本可以确定一个新种。这方面可以参考权威杂志IJSEM上的文章。目前，有人用MLSA乃至全基因组测序代替DNA-DNA杂交。

对于鉴定新种来说，全基因组测序应该不是必要的，一般都是为了进一步研究其它科学问题。当然，全基因组数据也可以作为菌种鉴定的重要证据。
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做一个阳光、开朗的小和尚
5楼2014-02-08 14:24:44
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