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hb魏静

金虫 (小有名气)

[求助] The type strain is SJ4T (=DSM 22704T = JCM 16185T). 已有1人参与

今天看文献的时候遇到这句话The type strain is SJ4T (=DSM 22704T = JCM 16185T)。请问这是什么意思啊?
还有我看到菌种的命名有的是Desulfosporosinus acidiphilus sp. nov.,有的是 Desulfosporosinus orientis DSM 765T,这是为什么啊?本人没有微生物学基础,还请高人指教,O(∩_∩)O~
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
hb魏静: 金币+10, 解释的非常清楚明白 2014-02-07 15:50:55
第一句是说模式菌株是SJ4T.SJ4T是菌株号,括号内是该菌株在不同保藏机构内的菌株名称。

Desulfosporosinus acidiphilus sp. nov.是作者鉴定了一个新种,初次发表时对于该新种进行命名。
Desulfosporosinus orientis DSM 765T,Desulfosporosinus orientis是属名+种加词,即种名; DSM 765T是菌株名称。
做一个阳光、开朗的小和尚
2楼2014-02-07 15:34:45
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hb魏静

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaozhibozhi at 2014-02-07 15:34:45
第一句是说模式菌株是SJ4T.SJ4T是菌株号,括号内是该菌株在不同保藏机构内的菌株名称。

Desulfosporosinus acidiphilus sp. nov.是作者鉴定了一个新种,初次发表时对于该新种进行命名。
Desulfosporosinus orie ...

哦,原来是这样,非常感谢O(∩_∩)O~金币都给你了
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3楼2014-02-07 15:50:58
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hb魏静

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhaozhibozhi at 2014-02-07 15:34:45
第一句是说模式菌株是SJ4T.SJ4T是菌株号,括号内是该菌株在不同保藏机构内的菌株名称。

Desulfosporosinus acidiphilus sp. nov.是作者鉴定了一个新种,初次发表时对于该新种进行命名。
Desulfosporosinus orie ...

呃,我又想起来一个问题,如何鉴定一个新菌种呢?为什么我看到有人用16SDNA,DNA-DNA杂交技术和生理学、形态学分析以后确定自己筛选出来的是新菌种,然后还有人对该菌种进行基因组测序呢?全测序是有必要的吗?
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4楼2014-02-07 16:03:58
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zhaozhibozhi

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by hb魏静 at 2014-02-07 16:03:58
呃,我又想起来一个问题,如何鉴定一个新菌种呢?为什么我看到有人用16SDNA,DNA-DNA杂交技术和生理学、形态学分析以后确定自己筛选出来的是新菌种,然后还有人对该菌种进行基因组测序呢?全测序是有必要的吗?...

对于细菌,一般结合形态理化特征、几种分子特征,以及DNA-DNA杂交基本可以确定一个新种。这方面可以参考权威杂志IJSEM上的文章。目前,有人用MLSA乃至全基因组测序代替DNA-DNA杂交。

对于鉴定新种来说,全基因组测序应该不是必要的,一般都是为了进一步研究其它科学问题。当然,全基因组数据也可以作为菌种鉴定的重要证据。
做一个阳光、开朗的小和尚
5楼2014-02-08 14:24:44
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hb魏静

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhaozhibozhi at 2014-02-08 14:24:44
对于细菌,一般结合形态理化特征、几种分子特征,以及DNA-DNA杂交基本可以确定一个新种。这方面可以参考权威杂志IJSEM上的文章。目前,有人用MLSA乃至全基因组测序代替DNA-DNA杂交。

对于鉴定新种来说,全基因组 ...

哦哦,知道了,太感谢了O(∩_∩)O~
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6楼2014-02-08 14:34:05
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