24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1318  |  回复: 5

lujunyan1118

金虫 (小有名气)

[求助] 用ONIOM做QM/MM,Checkpoint文件里面没有分子轨道的信息? 已有2人参与

各位好,我有个问题想请教下

我用ONIOM的方法做QM/MM,高层用B3LYP,低层用Amber,算完以后,我想看看HOMO和LUMO,我加了Pop=full,但是chk文件转成fchk文件后,用cubegen 说 缺少Alpha MO信息
Charge                                     I              -11
Multiplicity                               I                1
Number of electrons                        I             9416
Number of alpha electrons                  I             4708
Number of beta electrons                   I             4708
Number of basis functions                  I                0
Number of independent functions            I                0
Number of point charges in /Mol/           I                0
Number of translation vectors              I                0

fchk文件中Number of Basis functions也是0

用GV直接打开chk文件也说没有MO的信息? 这是为何?  如果只用QM计算高层区域(低层的全部去掉)可以正常获得轨道信息。

并且我发现,加上Freq关键字,check文件里面就有MO的信息,也可以画出分子轨道。但我加了Freq后会算死掉,说Out of memory。 我用4G的内存算, 高层80个左右原子,分子立场的有2000个左右,应该也不算太大, 这又是为何呢?能否只让gauss算高层的freq?

谢谢各位了!!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lujunyan1118

金虫 (小有名气)

%chk=snap396150.chk
%mem=4096MB
%nprocshared=8
# oniom(b3lyp/6-31+g*:amber) geom=connectivity pop=full


我的输入文件
2楼2014-01-20 19:38:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lujunyan1118

金虫 (小有名气)

等一下,没人回答
3楼2014-06-12 18:11:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arielroy

铜虫 (正式写手)

帮楼主顶一下。这个问题我也不懂
如满月,射天狼
4楼2014-07-28 14:20:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

greatqi

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

我觉得吧,不同的基组计算出来的MO系数之类的不匹配。
5楼2014-07-29 16:58:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xytk04

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

QM/MM下做freq是很占内存的,你增大内存就好了,输出文件会很大,chk打开看不到MO是正常的,你想想MO怎么来的,你有MM region怎么算MO?
6楼2014-12-23 11:37:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lujunyan1118 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料与化工考研调剂 +13 孅華 2026-03-22 13/650 2026-03-27 09:44 by caszguilin
[考研] 材料与化工085600,总分304,本科有两篇sci参与,求调剂 +6 幸运的酱酱 2026-03-22 7/350 2026-03-27 09:39 by caszguilin
[考研] 324求调剂 +8 hanamiko 2026-03-26 10/500 2026-03-27 08:06 by hypershenger
[考研] 325求调剂 +3 Aoyijiang 2026-03-23 3/150 2026-03-26 20:46 by 不吃魚的貓
[考研] 0703化学求调剂 +3 丹青奶盖 2026-03-26 5/250 2026-03-26 20:11 by macy2011
[考研] 07化学280分求调剂 +8 722865 2026-03-23 8/400 2026-03-26 20:00 by 不吃魚的貓
[考研] 0856求调剂 +8 zhn03 2026-03-25 9/450 2026-03-26 13:42 by zzll406
[考研] 一志愿 南京邮电大学 288分 材料考研 求调剂 +3 jl0720 2026-03-26 3/150 2026-03-26 13:39 by zzll406
[考研] 315分求调剂 +5 26考研上岸版26 2026-03-26 5/250 2026-03-26 12:11 by laoshidan
[考研] 07化学303求调剂 +5 睿08 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:46 by 418490947
[考研] 299求调剂 +7 某某某某位 2026-03-21 8/400 2026-03-25 20:34 by 热情沙漠
[考研] 293求调剂 +7 加一一九 2026-03-24 7/350 2026-03-25 12:02 by userper
[考研] 材料调剂 +3 iwinso 2026-03-23 3/150 2026-03-25 11:29 by greychen00
[考研] 一志愿南航材料专317分求调剂 +5 炸呀炸呀炸薯条 2026-03-23 5/250 2026-03-24 16:52 by 星空星月
[考研] 材料专硕331求调剂 +4 鲜当牛 2026-03-24 4/200 2026-03-24 15:58 by JourneyLucky
[考研] 335求调剂 +4 yuyu宇 2026-03-23 5/250 2026-03-23 23:49 by Txy@872106
[考研] 336求调剂 +4 收到VS 2026-03-20 4/200 2026-03-23 19:02 by macy2011
[考研] 0703化学297求调剂 +3 Daisy☆ 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:45 by ColorlessPI
[考研] 336求调剂 +5 rmc8866 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:24 by 学员8dgXkO
[考研] 材料与化工(0856)304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
信息提示
请填处理意见