24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1325  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lujunyan1118

金虫 (小有名气)

[求助] 用ONIOM做QM/MM,Checkpoint文件里面没有分子轨道的信息? 已有2人参与

各位好,我有个问题想请教下

我用ONIOM的方法做QM/MM,高层用B3LYP,低层用Amber,算完以后,我想看看HOMO和LUMO,我加了Pop=full,但是chk文件转成fchk文件后,用cubegen 说 缺少Alpha MO信息
Charge                                     I              -11
Multiplicity                               I                1
Number of electrons                        I             9416
Number of alpha electrons                  I             4708
Number of beta electrons                   I             4708
Number of basis functions                  I                0
Number of independent functions            I                0
Number of point charges in /Mol/           I                0
Number of translation vectors              I                0

fchk文件中Number of Basis functions也是0

用GV直接打开chk文件也说没有MO的信息? 这是为何?  如果只用QM计算高层区域(低层的全部去掉)可以正常获得轨道信息。

并且我发现,加上Freq关键字,check文件里面就有MO的信息,也可以画出分子轨道。但我加了Freq后会算死掉,说Out of memory。 我用4G的内存算, 高层80个左右原子,分子立场的有2000个左右,应该也不算太大, 这又是为何呢?能否只让gauss算高层的freq?

谢谢各位了!!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xytk04

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

QM/MM下做freq是很占内存的,你增大内存就好了,输出文件会很大,chk打开看不到MO是正常的,你想想MO怎么来的,你有MM region怎么算MO?
6楼2014-12-23 11:37:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

lujunyan1118

金虫 (小有名气)

%chk=snap396150.chk
%mem=4096MB
%nprocshared=8
# oniom(b3lyp/6-31+g*:amber) geom=connectivity pop=full


我的输入文件
2楼2014-01-20 19:38:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lujunyan1118

金虫 (小有名气)

等一下,没人回答
3楼2014-06-12 18:11:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

arielroy

铜虫 (正式写手)

帮楼主顶一下。这个问题我也不懂
如满月,射天狼
4楼2014-07-28 14:20:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 266求调剂 +8 阳阳哇塞 2026-03-27 9/450 2026-03-27 15:29 by caszguilin
[考研] 269专硕求调剂 +10 金恩贝 2026-03-21 10/500 2026-03-27 15:10 by caszguilin
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-25 7/350 2026-03-27 14:47 by 狂炫麦当当
[考研] 化学308分求调剂 +8 你好明天你好 2026-03-23 9/450 2026-03-27 14:01 by 杨光于青云
[考研] 一志愿211院校 344分 东北农业大学生物学学硕,求调剂 +5 丶风雪夜归人丶 2026-03-26 6/300 2026-03-27 10:15 by barness
[考研] 材料学硕,求调剂 6+5 糖葫芦888ll 2026-03-22 10/500 2026-03-27 08:18 by hypershenger
[考研] 324求调剂 +8 hanamiko 2026-03-26 10/500 2026-03-27 08:06 by hypershenger
[考研] 一志愿武汉理工,总分321,英一数二,求老师收留。 +5 nnnnnnn5 2026-03-25 5/250 2026-03-27 04:42 by wxiongid
[考研] 342求调剂 +3 加油a李zs 2026-03-26 3/150 2026-03-27 00:29 by wxiongid
[考研] 321求调剂 +6 Ymlll 2026-03-24 6/300 2026-03-26 20:50 by 不吃魚的貓
[考研] 求调剂 +5 芦lty 2026-03-25 6/300 2026-03-26 20:49 by 不吃魚的貓
[考研] 340求调剂 +3 Amber00 2026-03-26 3/150 2026-03-26 18:57 by 不吃魚的貓
[考研] 机械学硕总分317求调剂!!!! +4 Acaciad 2026-03-25 4/200 2026-03-25 19:59 by hanserlol
[考研] 生物技术与工程 +3 1294608413 2026-03-25 4/200 2026-03-25 18:02 by 1294608413
[考研] 300分,材料,求调剂,英一数二 +5 超赞的 2026-03-24 5/250 2026-03-24 21:07 by 星空星月
[考研] 300求调剂,材料科学英一数二 +5 leaflight 2026-03-24 5/250 2026-03-24 16:25 by laoshidan
[考研] 一志愿河北工业大学0817化工278分求调剂 +7 jhybd 2026-03-23 12/600 2026-03-24 09:03 by jhybd
[考研] 一志愿国科过程所081700,274求调剂 +3 三水研0水立方 2026-03-23 3/150 2026-03-23 23:11 by MajorWen
[考研] 297求调剂 +3 喜欢还是不甘心 2026-03-20 3/150 2026-03-21 18:33 by 学员8dgXkO
[考研] 266求调剂 +3 哇呼哼呼哼 2026-03-20 3/150 2026-03-21 16:46 by barlinike
信息提示
请填处理意见