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AMBER跑MD想同时加多个restraint,碰到的问题？ 已有1人参与
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我在用AMBER跑MD，想加多个restraint,请问有人知道怎么加吗？我做的输入文件如下： 我按照我这个输入文件加restraint，我看输出的out文件，系统只认最后一行的restraint，没有前几行的restraint。谢谢！ input file: &cntrl imin = 0, irest = 1, ntx = 7, ntb = 2, pres0 = 1.0, ntp = 1, taup = 2.0, cut = 12.0, ntr = 1, ntc = 2, ntf = 2, tempi = 300.0, temp0 = 300.0, ntt = 3, gamma_ln = 1.0, nstlim = 250000, dt = 0.002, ntpr = 1000, ntwx = 1000, ntwr = 1000, restraintmask = '(:62 >@10.0) & !@H=' restraint_wt = 12.0 restraintmask = '((:62 >@9.0) & (:62 <@10.0)) & !@H=' restraint_wt = 10.0 restraintmask = '((:62 >@8.0) & (:62 <@9.0)) & !@H=' restraint_wt = 8.0 restraintmask = '((:62 >@7.0) & (:62 <@8.0)) & !@H=' restraint_wt = 6.0 restraintmask = '((:62 >@6.0) & (:62 <@7.0)) & !@H=' restraint_wt = 4.0 restraintmask = '((:62 >@5.0) & (:62 <@6.0)) & !@H=' restraint_wt = 2.0, / Hold the 8HQ fixed 0.0 RES 1 225 END END |
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