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RAxML constraint分析
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我想用SH对1，2，3，4这四个种进行单系性检测，之前用raxml -f a -x 12345 -p 12345 -# 100 -m GTRGAMMAI -s infile -n outfile -o A, B, C 构建了一棵ML树，现在希望得到一棵树是将1，2，3，4这四个种强制作为单系的，我做如下定义：（（1,2,3,4）5,6,7,8,9,10,11,12），存为文件costraint.txt,再运行命令raxml -f a -x 12345 -p 12345 -g constraint.txt -# 100 -m GTRGAMMAI -s infile -n outfile -o A, B, C 但是程序提示说starting tree <s> will be ignored by rapid bootstrapping. 请问下我是哪儿出了问题，需要怎么改进？ |
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3楼2017-11-10 22:04:55