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上好佳wing

金虫 (小有名气)

[求助] RAxML constraint分析

我想用SH对1,2,3,4这四个种进行单系性检测,之前用raxml -f a -x 12345 -p 12345 -# 100 -m GTRGAMMAI -s infile -n outfile -o A, B, C 构建了一棵ML树,现在希望得到一棵树是将1,2,3,4这四个种强制作为单系的,我做如下定义:((1,2,3,4)5,6,7,8,9,10,11,12),存为文件costraint.txt,再运行命令raxml -f a -x 12345 -p 12345 -g constraint.txt -# 100 -m GTRGAMMAI -s infile -n outfile -o A, B, C
但是程序提示说starting tree <s> will be ignored by rapid bootstrapping.
请问下我是哪儿出了问题,需要怎么改进?
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甘志彬

铜虫 (小有名气)

楼主知道怎么生成MAxML的可执行phy文件吗?我用其他软件生成的phy文件导入不了MAxML
2楼2014-05-22 19:37:53
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zzbbyy

新虫 (初入文坛)

3楼2017-11-10 22:04:55
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