24小时热门版块排行榜    

查看: 2350  |  回复: 15

unforget408

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
tdairy09: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2014-01-11 08:59:14
tdairy09: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-01-19 09:54:12
之前做编码区预测时弄过,先下载FASTA格式的基因序列,用MATLAB编程根据CDS.txt文件里指定的每个编码区的起止碱基号,从基因组序列中把需要的序列截取出来另存。这样一次处理上千的序列都没问题。
11楼2014-01-10 23:51:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

spirit87

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/3894097
如果你的菌全基因测序,参考一下这个链接,这是其他菌的一个基因在全基因组的位置
12楼2014-01-11 08:06:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tdairy09

金虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by unforget408 at 2014-01-10 23:51:44
之前做编码区预测时弄过,先下载FASTA格式的基因序列,用MATLAB编程根据CDS.txt文件里指定的每个编码区的起止碱基号,从基因组序列中把需要的序列截取出来另存。这样一次处理上千的序列都没问题。

多谢,看来是专家级别的了
在坚持中创新
13楼2014-01-11 09:00:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lcat

木虫 (小有名气)

如果是本地电脑的fasta格式基因组文件的话,可以用bioedit软件打开,用菜单栏的sequence里边select positions或者extract positions来截取,挺方便的。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

14楼2014-01-13 06:51:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

tdairy09

金虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
14楼: Originally posted by lcat at 2014-01-13 06:51:56
如果是本地电脑的fasta格式基因组文件的话,可以用bioedit软件打开,用菜单栏的sequence里边select positions或者extract positions来截取,挺方便的。

多谢!新年快乐!
在坚持中创新
15楼2014-01-19 09:57:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

klds527

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
tdairy09: 金币+10, ★★★很有帮助 2014-01-19 13:19:34
bioedit和DNAman都可以,只是基因组长度不要过大
努力就会有收获
16楼2014-01-19 13:18:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 tdairy09 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿中国海洋大学,生物学,301分,求调剂 +5 1孙悟空 2026-03-17 5/250 2026-03-19 18:03 by zcl123
[考研] 梁成伟老师课题组欢迎你的加入 +9 一鸭鸭哟 2026-03-14 11/550 2026-03-19 17:22 by !本暗一次!
[考研] 材料专硕274一志愿陕西师范大学求调剂 +8 薛云鹏 2026-03-13 8/400 2026-03-19 15:36 by haoshis
[考研] 085601材料工程专硕求调剂 +10 慕寒mio 2026-03-16 10/500 2026-03-19 15:26 by 丁丁*
[考研] 求调剂 +3 Mqqqqqq 2026-03-19 3/150 2026-03-19 14:11 by peike
[考研] 化学求调剂 +3 临泽境llllll 2026-03-17 4/200 2026-03-19 13:59 by houyaoxu
[考研] 材料专硕英一数二306 +5 z1z2z3879 2026-03-18 5/250 2026-03-19 07:43 by BruceLiu320
[考研] 304求调剂 +6 司空. 2026-03-18 6/300 2026-03-18 23:03 by 星空星月
[考研] 330求调剂 +3 小材化本科 2026-03-18 3/150 2026-03-18 21:55 by 无懈可击111
[考研] 0703化学336分求调剂 +6 zbzihdhd 2026-03-15 7/350 2026-03-18 09:53 by zhukairuo
[考研] 301求调剂 +4 A_JiXing 2026-03-16 4/200 2026-03-17 17:32 by ruiyingmiao
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[论文投稿] 有没有大佬发小论文能带我个二作 +3 增锐漏人 2026-03-17 4/200 2026-03-17 09:26 by xs74101122
[考研] 283求调剂 +3 听风就是雨; 2026-03-16 3/150 2026-03-17 07:41 by 热情沙漠
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 277材料科学与工程080500求调剂 +3 自由煎饼果子 2026-03-16 3/150 2026-03-16 14:10 by 运气yunqi
[考研] 0856求调剂 +3 刘梦微 2026-03-15 3/150 2026-03-16 10:00 by houyaoxu
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[考研] 289求调剂 +4 这么名字咋样 2026-03-14 6/300 2026-03-14 18:58 by userper
[考研] 学硕285求调剂 +13 Wisjxn 2026-03-12 46/2300 2026-03-14 10:33 by JourneyLucky
信息提示
请填处理意见