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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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熙玥

新虫 (初入文坛)


[交流] 已知CDS,求启动子序列

请教各位大虾,梅基因组测序已完成,我现在根据其数据库克隆得到该一个基因的完整CDS,然后准备克该基因的上游启动子区,我直接用CDS和基因组数据对比,发现与其中的一条染色体的E值为0 ,但是出现了以下情况,5'和3'出现颠倒的现象,即ATG 的位置在TGA后,我就不确定用这种方法找的启动子对不对?
急!急!急!
已知CDS,求启动子序列
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已知CDS,求启动子序列-1
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yuyin

金虫 (小有名气)


★ ★ ★ ★ ★
熙玥: 金币+5, 谢谢,试着做了一下,出来了! 2014-03-19 16:03:05
你可以取ATG上游1000,下游200此区域进行克隆(一般基因启动子区都在此范围内),你这个对应的基因组是反向的,如果是11736728开始的话,那么你所需克隆的区域为:11737728-11736528
8楼2014-03-19 15:59:11
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Neo2000

木虫 (著名写手)


你看到的可能是互补序列,向右找应该没错

[ 发自小木虫客户端 ]
9楼2014-04-12 07:35:11
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2013-12-26 00:07   回复  
熙玥(金币+1): 谢谢参与
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