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ljj0720

银虫 (正式写手)

[求助] 引物中有2个起始密码子 已有4人参与

我在做原核表达,设计引物的时候,上游引物出现2个起始密码子,可以吗
S:  S:  5’ ATGCTCAATTTTATGACAAAG  3’

[ Last edited by ljj0720 on 2013-12-25 at 13:29 ]
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gaoshandian1

金虫 (小有名气)

★ ★ ★ ★ ★
gyesang: 金币+5, 鼓励交流! 2013-12-28 20:58:00
gyesang: 回帖置顶 2013-12-28 20:58:02
楼主要小心了,看你的引物上游用了ECORI酶切位点。酶切位点不是直接加上就行的。还要看载体的这个酶切位点是怎么编码氨基酸的。比方说载体上是AGA  ATT CAA 这样的,你的引物就不能用。另外,这是原核表达。就别再在这里讨论KOZAK序列了

[ 发自小木虫客户端 ]
15楼2013-12-28 14:27:27
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

ljj0720

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-12-25 15:24:33
引物里是否包括酶切位点和保护碱基?第二个ATG是目的基因的起始?如果你最终克隆到载体里的序列有两个相近的ATG,会造成不同的起始,不过你的两个ATG是in frame的,应该没有问题。

您帮我i再看看吧 谢谢
4楼2013-12-25 18:39:34
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普通回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2013-12-25 20:54:16
ljj0720: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-12-27 07:37:55
引物里是否包括酶切位点和保护碱基?第二个ATG是目的基因的起始?如果你最终克隆到载体里的序列有两个相近的ATG,会造成不同的起始,不过你的两个ATG是in frame的,应该没有问题。
2楼2013-12-25 15:24:33
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ljj0720

银虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-12-25 15:24:33
引物里是否包括酶切位点和保护碱基?第二个ATG是目的基因的起始?如果你最终克隆到载体里的序列有两个相近的ATG,会造成不同的起始,不过你的两个ATG是in frame的,应该没有问题。

S:  5’ CCGGAATTCATGCTCAATTTTATGACAAAG  3’
下划线的是酶切位点
3楼2013-12-25 18:38:08
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ljj0720 at 2013-12-25 18:38:08
S:  5’ CCGGAATTCATGCTCAATTTTATGACAAAG  3’
下划线的是酶切位点...

我觉得没什么问题,前面多了两个氨基酸残基,对表达产物没太多影响。
5楼2013-12-26 03:23:31
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liduanzhuo

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-26 15:42:55
ljj0720: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-12-27 07:38:19
ljj0720: 金币+3 2013-12-27 07:39:46
翻译起始的时候,核糖体识别的是kozak序列后面的第一个ATG,也就是前面的那个ATG,这个没有问题的。
6楼2013-12-26 14:46:05
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+1, 鼓励交流! 2013-12-26 15:43:04
后一个ATG只是一个普通的甲硫氨酸,你只要确认你的基因的相对位置确实存在ATG就没有任何问题
大家相互帮助哈
7楼2013-12-26 15:31:42
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bolysu

禁虫 (著名写手)

感谢参与,应助指数 +1
本帖内容被屏蔽

8楼2013-12-26 15:40:47
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ljj0720

银虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by cicelyzh at 2013-12-26 03:23:31
我觉得没什么问题,前面多了两个氨基酸残基,对表达产物没太多影响。...

恩  好的 谢谢
9楼2013-12-27 07:38:09
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ljj0720

银虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by liduanzhuo at 2013-12-26 14:46:05
翻译起始的时候,核糖体识别的是kozak序列后面的第一个ATG,也就是前面的那个ATG,这个没有问题的。

恩 谢谢 想问一下  kozak序列是什么东东
10楼2013-12-27 07:40:19
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