应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 画图时氢键怎么画呢？
131/2返回列表12下一页
查看: 6315  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

等待蝉唱

铁虫 (小有名气)

[求助] 画图时氢键怎么画呢？ 已有2人参与

请问用软件画图时氢键是直接连接吗？？？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-12-25 11:51:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyfxie8607

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 欢迎讨论交流 2013-12-26 12:59:01
等待蝉唱: 金币+3, ★有帮助 2013-12-27 13:42:56
软件分析，不能自己画的。
如果是pdb文件的话，用Discovery Studio看，里面有帮忙分析氢键的工具。
赞一下 回复此楼
2楼2013-12-26 09:00:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wekow

禁虫 (小有名气)
★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
月只蓝: 金币+1, 欢迎讨论交流 2013-12-26 12:59:16
等待蝉唱: 金币+3, ★有帮助 2013-12-27 13:43:09
本帖内容被屏蔽
3楼2013-12-26 11:21:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

等待蝉唱

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lyfxie8607 at 2013-12-26 09:00:57
软件分析，不能自己画的。
如果是pdb文件的话，用Discovery Studio看，里面有帮忙分析氢键的工具。

那我在画图时怎么体现出有氢键呢？

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
4楼2013-12-26 20:55:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

等待蝉唱

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by wekow at 2013-12-26 11:21:11
一般情况下用虚线画氢键。

那在用MS画图时怎么画呢

[ 发自小木虫客户端 ]
赞一下 回复此楼
5楼2013-12-26 20:57:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lyfxie8607

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
等待蝉唱: 金币+4, ★有帮助 2013-12-27 13:43:21
引用回帖:
4楼: Originally posted by 等待蝉唱 at 2013-12-26 20:55:25
那我在画图时怎么体现出有氢键呢？
...

一般是虚线，如果软件确定有氢键存在会将氢键供体的原子和氢键受体的原子连接起来。
赞一下 回复此楼
6楼2013-12-26 21:13:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ningll10

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
等待蝉唱(月只蓝代发): 金币+2, 鼓励交流！ 2014-05-31 20:51:48
如果有PDB文件或其他格式的坐标文件的话，可以直接在VMD中画出来，VMD是开源的，直接下。graphics-representation-drawing method-hbond,可以手动调氢键的距离和角度，颜色和宽度也可以调整。
赞一下 回复此楼
7楼2013-12-26 22:12:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

等待蝉唱

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by lyfxie8607 at 2013-12-26 21:13:34
一般是虚线，如果软件确定有氢键存在会将氢键供体的原子和氢键受体的原子连接起来。...

意思是软件会自动的把氢键添上的？？？
赞一下 回复此楼
8楼2013-12-27 13:33:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

等待蝉唱

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by ningll10 at 2013-12-26 22:12:52
如果有PDB文件或其他格式的坐标文件的话，可以直接在VMD中画出来，VMD是开源的，直接下。graphics-representation-drawing method-hbond,可以手动调氢键的距离和角度，颜色和宽度也可以调整。

这个，不懂啊
回复此楼
9楼2013-12-27 13:44:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ningll10

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-01-03 17:02:04
引用回帖:
9楼: Originally posted by 等待蝉唱 at 2013-12-27 13:44:03
这个，不懂啊...

就是装一个VMD软件，按照我说的操作，就可以了
赞一下 回复此楼
10楼2014-01-03 15:47:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 等待蝉唱 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭