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caochen

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[求助] P450 heme环 在加力场参数时候出现问题 已有1人参与

现在想对P450进行MD后的数据取样分析,使用amber先load heme.prep和 fromcd文件,然后loadpdb P450蛋白进行check,为什么会amber会提示could not find angle parameter :HS-SH-FE。我将loadpdb后的pdb文件打开,发现原来CYS-的硫多了一个氢。和原来和FE共价连接的那个键断了
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祭奠
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smutao

禁虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
caochen: 金币+10, 有帮助, 谢谢 还是 不行。。。 2014-05-17 15:04:58
本帖内容被屏蔽

2楼2013-12-29 20:06:23
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