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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » 专家会诊 » P450 heme环 在加力场参数时候出现问题
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caochen

捐助贵宾 (正式写手)

[求助] P450 heme环 在加力场参数时候出现问题 已有1人参与

现在想对P450进行MD后的数据取样分析，使用amber先load heme.prep和 fromcd文件，然后loadpdb P450蛋白进行check，为什么会amber会提示could not find angle parameter :HS-SH-FE。我将loadpdb后的pdb文件打开，发现原来CYS-的硫多了一个氢。和原来和FE共价连接的那个键断了
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祭奠
1楼 2013-12-23 22:37:36
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smutao

禁虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
caochen: 金币+10, ★有帮助, 谢谢 还是 不行。。。 2014-05-17 15:04:58
本帖内容被屏蔽
2楼2013-12-29 20:06:23
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