24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2457  |  回复: 13

xiaoyang1010

金虫 (小有名气)

[求助] 我算的C60碳谱不是单峰,该怎么办 已有3人参与

那位大侠算过C60的NMR,理论上讲C60的碳谱应该是单峰,在143 ppm左右,为什么我用Gauss09算的在149-152 ppm有N多峰(如图)?有什么方法可以解决这个问题不?
C60优化用的是#p b3lyp/6-31g* opt=Cartesian freq=noraman
优化后,计算NMR用的是#p nmr=giao B3LYP/6-311+g(2d,p)
我用同样的方法算TMS,结果碳谱竟然是四个峰,也不是单峰!这该怎么办?小弟还是新手,望各位大牛指点一二啊!我算的C60碳谱不是单峰,该怎么办
C60碳谱计算结果.jpg
第一次上传图片,出了点小问题,附件1和附件2是一样的,都是我计算的C60的碳谱的截图
附件3是我计算的.log文件[ Last edited by xiaoyang1010 on 2013-12-23 at 19:21 ]
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : C60碳谱.jpg
  • 2013-12-23 19:04:18, 141.26 K
  • 附件 2 : C60碳谱计算结果.jpg
  • 2013-12-23 19:04:40, 141.26 K
  • 附件 3 : C60-c.log
  • 2013-12-23 19:09:52, 96.04 K

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiaoyang1010: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常好 2013-12-24 10:05:26
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaoyang1010 at 2013-12-23 19:30:42
我感觉也是这个问题,我在Point Group里查了一下,优化后是Ci对称性,比实际的Ih对称性要低,该加什么命令来对称性控制呢?...

point group不光能查看对称性,也能对分子进行对称化操作。

从GV的模板中拿出来的C60并不是严格对称的,附件图Point Group Symmetry窗口的左上角的对勾点上后,你可以看到
Current point group一项是Ci,说明当前的结构不是预期的Ih,但Approximate higher-order point groups一项已经显示为Ih,说明GV已经看出来这个分子非常接近Ih,如果这个地方没有Ih,可以调节后面的那个Tolerance,用Losse或者Very loose等,直到GV能认出来,如果放到Do you feel lucky?都没有找到,说明当前结构搭建的太不对称了。
搭建高对称性分子时,在找到了预期的点群之后,一定要点那个Symmetrize,也就是对称化一下,当前的结构才能变为想要的点群。之后再在Current point group后面看到你要的点群符号才算把结构建好了。
我算的C60碳谱不是单峰,该怎么办-1
GV.png

据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
6楼2013-12-24 08:19:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

lkui486

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xiaoyang1010: 金币+2, ★★★很有帮助, good 2013-12-23 19:31:35
gkf高: 金币+2 2013-12-23 20:00:19
这个也许是对称性的问题。说明你建的模型中的所有C不是完全的等效碳。另外可能得对称性控制!

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2013-12-23 19:23:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoyang1010

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lkui486 at 2013-12-23 19:23:42
这个也许是对称性的问题。说明你建的模型中的所有C不是完全的等效碳。另外可能得对称性控制!

我感觉也是这个问题,我在Point Group里查了一下,优化后是Ci对称性,比实际的Ih对称性要低,该加什么命令来对称性控制呢?
3楼2013-12-23 19:30:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lkui486

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
xiaoyang1010: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-12-24 10:07:38
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaoyang1010 at 2013-12-23 19:30:42
我感觉也是这个问题,我在Point Group里查了一下,优化后是Ci对称性,比实际的Ih对称性要低,该加什么命令来对称性控制呢?...

似乎在Symm里面得用tight?另外建模得关注一下。

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2013-12-23 19:37:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoyang1010

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by lkui486 at 2013-12-23 19:37:29
似乎在Symm里面得用tight?另外建模得关注一下。
...

分子模型的话……其实我还优化过比较简单的四甲基硅烷,然后再算碳谱,结果出了四个峰,也不是理论上的单峰
5楼2013-12-23 20:18:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoyang1010

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hairan at 2013-12-24 08:19:49
point group不光能查看对称性,也能对分子进行对称化操作。

从GV的模板中拿出来的C60并不是严格对称的,附件图Point Group Symmetry窗口的左上角的对勾点上后,你可以看到
Current point group一项是Ci,说明当 ...

太感谢了!我再试试看!
7楼2013-12-24 10:26:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoyang1010

金虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by hairan at 2013-12-24 08:19:49
point group不光能查看对称性,也能对分子进行对称化操作。

从GV的模板中拿出来的C60并不是严格对称的,附件图Point Group Symmetry窗口的左上角的对勾点上后,你可以看到
Current point group一项是Ci,说明当 ...

你好!我按照你的方法对C60进行对称化操作之后又用#p b3lyp/6-31g* opt=Cartesian freq=noraman 进行了优化,在point group里查看已经是Ih对称性了(附件C60-Ih),然后我又用#p nmr=giao B3LYP/6-311+g(2d,p)来计算碳谱,结果得到的依然不是单峰(附件C60碳谱),是不是我在计算碳谱是也要加什么对称性的命令啊?麻烦帮帮忙啊!
我算的C60碳谱不是单峰,该怎么办-2
C60碳谱.png

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : C60-Ih.log
  • 2013-12-27 10:46:17, 688.48 K
  • 附件 2 : 碳谱.log
  • 2013-12-27 10:46:20, 95.43 K
8楼2013-12-27 10:47:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-01-06 18:26:52
引用回帖:
8楼: Originally posted by xiaoyang1010 at 2013-12-27 10:47:45
你好!我按照你的方法对C60进行对称化操作之后又用#p b3lyp/6-31g* opt=Cartesian freq=noraman 进行了优化,在point group里查看已经是Ih对称性了(附件C60-Ih),然后我又用#p nmr=giao B3LYP/6-311+g(2d,p)来计 ...

你的分子仍然不是对称的,Gaussian软件觉得很接近对称了,但还没有完全对称。附件图片是你的输出文件的截图。
这里面需要注意一点,就是GaussView对称化得到的Ih结构有时候Gaussian并不一定能认出来。
你可以在优化时加上symm=loose,或者不行就用symm=veryloose,这样优化完的结构就应该是完全对称的。着那这个优化的结构去做计算。
我算的C60碳谱不是单峰,该怎么办-3
pg.png

据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
9楼2013-12-28 12:20:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoyang1010

金虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by hairan at 2013-12-28 12:20:13
你的分子仍然不是对称的,Gaussian软件觉得很接近对称了,但还没有完全对称。附件图片是你的输出文件的截图。
这里面需要注意一点,就是GaussView对称化得到的Ih结构有时候Gaussian并不一定能认出来。
你可以在优 ...

太麻烦你了!但是我按照你的方法用#p b3lyp/6-31g* opt=Cartesian freq=noraman symm=loose来优化,得到的结果好像是Ih对称性的(用symm=veryloose得到的结果是一样的),但是我用它再算碳谱,得到的仍然不是单峰。附件是优化和计算碳谱的结果,麻烦再帮我看看啊!看有什么解决方法没,拜托了!
我算的C60碳谱不是单峰,该怎么办-4
新建位图图像.png

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : C60-loose.log
  • 2014-01-04 20:49:21, 696.76 K
  • 附件 2 : C60-loose-c.log
  • 2014-01-04 20:49:24, 101.78 K
  • 附件 3 : C60-veryloose.log
  • 2014-01-04 20:49:27, 696.74 K
  • 附件 4 : C60-veryloose-c.log
  • 2014-01-04 20:49:28, 101.17 K
10楼2014-01-04 21:05:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xiaoyang1010 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 271求调剂 +20 2261744733 2026-04-11 22/1100 2026-04-11 23:14 by labixiaoqiao
[考研] 一志愿厦大0856,306求调剂 +15 Bblinging 2026-04-11 15/750 2026-04-11 22:53 by 314126402
[考研] 270求调剂 +14 杨乐369 2026-04-11 14/700 2026-04-11 20:16 by 蓝云思雨
[考研] 0859,337求调剂 +4 研s. 2026-04-10 4/200 2026-04-11 11:34 by caotw2020
[考研] 22408 352分求调剂 +4 努力的夏末 2026-04-09 4/200 2026-04-11 10:42 by maddjdld
[考研] 0854调剂 +4 长弓傲 2026-04-09 4/200 2026-04-11 09:18 by 猪会飞
[考研] 一志愿211,化学学硕,310分,本科重点双非,求调剂 +17 努力奋斗112 2026-04-06 20/1000 2026-04-11 00:31 by wangjihu
[考研] 一志愿京区985,085401,与本科专业一致,电子信息工程, +4 阳光开朗的男孩 2026-04-10 4/200 2026-04-10 18:27 by shenrf
[考研] 一志愿沪9,326生物学求相关专业调剂 +4 刘墨墨 2026-04-09 4/200 2026-04-10 12:07 by pengliang8036
[考研] 求调剂 材料与工程 324分 专硕 +19 翩翩一书生 2026-04-10 21/1050 2026-04-10 11:41 by wp06
[考研] 070300化学 求调剂 +13 73372112 2026-04-08 13/650 2026-04-09 20:22 by maddjdld
[考研] 一志愿0807 数一英一 313 有没有二轮调剂 +11 emokidd 2026-04-08 12/600 2026-04-09 09:24 by wyf236
[考研] 求调剂 +7 chenxrlkx 2026-04-05 9/450 2026-04-09 09:04 by wj165256
[考博] 材料方向考博,求推荐 +3 言语aaa 2026-04-05 4/200 2026-04-08 22:22 by nxgogo
[考研] 331求调剂 +5 luoxin0706. 2026-04-08 5/250 2026-04-08 22:15 by zhouyuwinner
[考研] 277求调剂 +4 考研调剂lxh 2026-04-06 6/300 2026-04-08 10:40 by 逆水乘风
[考研] 277求调剂 数一104分 +9 瓶子PZ 2026-04-05 14/700 2026-04-07 17:52 by 蓝云思雨
[考研] 材料求调剂 +18 一样YWY 2026-04-05 18/900 2026-04-07 15:49 by dxlg
[考研] 考研调剂生寻找导师 +3 顾瞻考研啊 2026-04-05 3/150 2026-04-05 18:18 by 啵啵啵0119
[考研] 一志愿北交大材料工程总分358求调剂 +6 cs0106 2026-04-05 6/300 2026-04-05 16:34 by imissbao
信息提示
请填处理意见