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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 我算的C60碳谱不是单峰，该怎么办
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xiaoyang1010

金虫 (小有名气)

[求助] 我算的C60碳谱不是单峰，该怎么办 已有3人参与

那位大侠算过C60的NMR，理论上讲C60的碳谱应该是单峰，在143 ppm左右，为什么我用Gauss09算的在149-152 ppm有N多峰(如图)？有什么方法可以解决这个问题不？
C60优化用的是#p b3lyp/6-31g* opt=Cartesian freq=noraman
优化后，计算NMR用的是#p nmr=giao B3LYP/6-311+g(2d,p)
我用同样的方法算TMS，结果碳谱竟然是四个峰，也不是单峰！这该怎么办？小弟还是新手，望各位大牛指点一二啊！我算的C60碳谱不是单峰，该怎么办
C60碳谱计算结果.jpg
第一次上传图片，出了点小问题，附件1和附件2是一样的，都是我计算的C60的碳谱的截图
附件3是我计算的.log文件[ Last edited by xiaoyang1010 on 2013-12-23 at 19:21 ]
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  • 附件 1 : C60碳谱.jpg
    • 2013-12-23 19:04:18, 141.26 K
  • 附件 2 : C60碳谱计算结果.jpg
    • 2013-12-23 19:04:40, 141.26 K
  • 附件 3 : C60-c.log
    • 2013-12-23 19:09:52, 96.04 K

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1楼 2013-12-23 19:05:09
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiaoyang1010: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常好 2013-12-24 10:05:26
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaoyang1010 at 2013-12-23 19:30:42
我感觉也是这个问题，我在Point Group里查了一下，优化后是Ci对称性，比实际的Ih对称性要低，该加什么命令来对称性控制呢？...

point group不光能查看对称性，也能对分子进行对称化操作。

从GV的模板中拿出来的C60并不是严格对称的，附件图Point Group Symmetry窗口的左上角的对勾点上后，你可以看到
Current point group一项是Ci，说明当前的结构不是预期的Ih，但Approximate higher-order point groups一项已经显示为Ih，说明GV已经看出来这个分子非常接近Ih，如果这个地方没有Ih，可以调节后面的那个Tolerance，用Losse或者Very loose等，直到GV能认出来，如果放到Do you feel lucky？都没有找到，说明当前结构搭建的太不对称了。
搭建高对称性分子时，在找到了预期的点群之后，一定要点那个Symmetrize，也就是对称化一下，当前的结构才能变为想要的点群。之后再在Current point group后面看到你要的点群符号才算把结构建好了。
我算的C60碳谱不是单峰，该怎么办-1
GV.png
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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。
6楼2013-12-24 08:19:49
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普通回帖

lkui486

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiaoyang1010: 金币+2, ★★★很有帮助, good 2013-12-23 19:31:35
gkf高: 金币+2 2013-12-23 20:00:19
这个也许是对称性的问题。说明你建的模型中的所有C不是完全的等效碳。另外可能得对称性控制！

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2楼2013-12-23 19:23:42
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xiaoyang1010

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by lkui486 at 2013-12-23 19:23:42
这个也许是对称性的问题。说明你建的模型中的所有C不是完全的等效碳。另外可能得对称性控制！

我感觉也是这个问题，我在Point Group里查了一下，优化后是Ci对称性，比实际的Ih对称性要低，该加什么命令来对称性控制呢？
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3楼2013-12-23 19:30:42
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lkui486

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
xiaoyang1010: 金币+2, ★★★很有帮助 2013-12-24 10:07:38
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaoyang1010 at 2013-12-23 19:30:42
我感觉也是这个问题，我在Point Group里查了一下，优化后是Ci对称性，比实际的Ih对称性要低，该加什么命令来对称性控制呢？...

似乎在Symm里面得用tight？另外建模得关注一下。

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4楼2013-12-23 19:37:29
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xiaoyang1010

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by lkui486 at 2013-12-23 19:37:29
似乎在Symm里面得用tight？另外建模得关注一下。
...

分子模型的话……其实我还优化过比较简单的四甲基硅烷，然后再算碳谱，结果出了四个峰，也不是理论上的单峰
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5楼2013-12-23 20:18:17
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xiaoyang1010

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hairan at 2013-12-24 08:19:49
point group不光能查看对称性，也能对分子进行对称化操作。

从GV的模板中拿出来的C60并不是严格对称的，附件图Point Group Symmetry窗口的左上角的对勾点上后，你可以看到
Current point group一项是Ci，说明当 ...

太感谢了！我再试试看！
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7楼2013-12-24 10:26:33
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xiaoyang1010

金虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by hairan at 2013-12-24 08:19:49
point group不光能查看对称性，也能对分子进行对称化操作。

从GV的模板中拿出来的C60并不是严格对称的，附件图Point Group Symmetry窗口的左上角的对勾点上后，你可以看到
Current point group一项是Ci，说明当 ...

你好！我按照你的方法对C60进行对称化操作之后又用#p b3lyp/6-31g* opt=Cartesian freq=noraman 进行了优化，在point group里查看已经是Ih对称性了（附件C60-Ih），然后我又用#p nmr=giao B3LYP/6-311+g(2d,p)来计算碳谱，结果得到的依然不是单峰（附件C60碳谱），是不是我在计算碳谱是也要加什么对称性的命令啊？麻烦帮帮忙啊！
我算的C60碳谱不是单峰，该怎么办-2
C60碳谱.png
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  • 附件 1 : C60-Ih.log
    • 2013-12-27 10:46:17, 688.48 K
  • 附件 2 : 碳谱.log
    • 2013-12-27 10:46:20, 95.43 K
8楼2013-12-27 10:47:45
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-01-06 18:26:52
引用回帖:
8楼: Originally posted by xiaoyang1010 at 2013-12-27 10:47:45
你好！我按照你的方法对C60进行对称化操作之后又用#p b3lyp/6-31g* opt=Cartesian freq=noraman 进行了优化，在point group里查看已经是Ih对称性了（附件C60-Ih），然后我又用#p nmr=giao B3LYP/6-311+g(2d,p)来计 ...

你的分子仍然不是对称的，Gaussian软件觉得很接近对称了，但还没有完全对称。附件图片是你的输出文件的截图。
这里面需要注意一点，就是GaussView对称化得到的Ih结构有时候Gaussian并不一定能认出来。
你可以在优化时加上symm=loose，或者不行就用symm=veryloose，这样优化完的结构就应该是完全对称的。着那这个优化的结构去做计算。
我算的C60碳谱不是单峰，该怎么办-3
pg.png
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9楼2013-12-28 12:20:13
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xiaoyang1010

金虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by hairan at 2013-12-28 12:20:13
你的分子仍然不是对称的，Gaussian软件觉得很接近对称了，但还没有完全对称。附件图片是你的输出文件的截图。
这里面需要注意一点，就是GaussView对称化得到的Ih结构有时候Gaussian并不一定能认出来。
你可以在优 ...

太麻烦你了！但是我按照你的方法用#p b3lyp/6-31g* opt=Cartesian freq=noraman symm=loose来优化，得到的结果好像是Ih对称性的（用symm=veryloose得到的结果是一样的），但是我用它再算碳谱，得到的仍然不是单峰。附件是优化和计算碳谱的结果，麻烦再帮我看看啊！看有什么解决方法没，拜托了！
我算的C60碳谱不是单峰，该怎么办-4
新建位图图像.png
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  • 附件 1 : C60-loose.log
    • 2014-01-04 20:49:21, 696.76 K
  • 附件 2 : C60-loose-c.log
    • 2014-01-04 20:49:24, 101.78 K
  • 附件 3 : C60-veryloose.log
    • 2014-01-04 20:49:27, 696.74 K
  • 附件 4 : C60-veryloose-c.log
    • 2014-01-04 20:49:28, 101.17 K
10楼2014-01-04 21:05:28
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