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xiaoke413

至尊木虫 (知名作家)

[求助] 求教radius of gyration(回转半径)相关的问题,谢谢各位虫友!

小弟知道MS可以用forcite或discover算出一个分子的radius of gyration,但是我想从MS中输出radius of gyration 随模拟时间变化的文件,不知道各位虫友有什么办法,比如pearl script编程什么的,小弟不甚感激!

[ Last edited by xiaoke413 on 2013-12-19 at 11:46 ]
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xiaoke413(月只蓝代发): 金币+20, 感谢指导! 2014-05-31 21:14:38
月只蓝: 应助指数+1 2014-05-31 21:14:47
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaoke413 at 2013-12-23 09:05:22
感谢您的回答,为什么我不能给你金币啊?
通过您的方法,我把体系导入到study table中了,不过运行失败,可能是因为我的体系是一个含有聚合物和水分子的二元体系,我得怎么样才能在study table中标记处聚合物呢? ...

确实我也没计算出来。。。

我是在无定型晶胞放的2个小分子。。。
提示不支持周期性结构计算。。。。


这样你只能用forcite计算了。。。。
把xtd导入table
一个个结构复制出来计算。。。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2013-12-23 10:07:09
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查看全部 7 个回答

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+2, 感谢指导! 2013-12-20 16:07:02
xiaoke413(月只蓝代发): 金币+30, 感谢指导! 2014-05-31 21:14:22
月只蓝: 应助指数+1 2014-05-31 21:14:43
peal肯定可以
印象中help里有peal的例子
对于做很多重复性计算很方便


不过貌似radius of gyration还不需要peal
看图
xtd文件导入空白study table
运行QSAR
有radius of gyration的计算
求教radius of gyration(回转半径)相关的问题,谢谢各位虫友!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2013-12-20 13:53:42
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xiaoke413

至尊木虫 (知名作家)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2013-12-20 13:53:42
peal肯定可以
印象中help里有peal的例子
对于做很多重复性计算很方便


不过貌似radius of gyration还不需要peal
看图
xtd文件导入空白study table
运行QSAR
有radius of gyration的计算
...

感谢您的回答,为什么我不能给你金币啊?
通过您的方法,我把体系导入到study table中了,不过运行失败,可能是因为我的体系是一个含有聚合物和水分子的二元体系,我得怎么样才能在study table中标记处聚合物呢?因为我想在算聚合物的ROG
3楼2013-12-23 09:05:22
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xiaoke413

至尊木虫 (知名作家)

送红花一朵
月只蓝: 如需代发金币给应助者,请联系版主,并写明金币数量。 2013-12-23 16:15:50
引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2013-12-23 10:07:09
确实我也没计算出来。。。

我是在无定型晶胞放的2个小分子。。。
提示不支持周期性结构计算。。。。


这样你只能用forcite计算了。。。。
把xtd导入table
一个个结构复制出来计算。。。...

谢谢你的帮忙,这种方法虽然比较麻烦,但还是有用的,谢谢了~
不知道为什么金币好像给不了你,再给你一朵红花,真心感谢~
5楼2013-12-23 11:34:01
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