应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 求教radius of gyration(回转半径)相关的问题，谢谢各位虫友！
71/1返回列表
查看: 2312  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

xiaoke413

至尊木虫 (职业作家)

[求助] 求教radius of gyration(回转半径)相关的问题，谢谢各位虫友！

小弟知道MS可以用forcite或discover算出一个分子的radius of gyration，但是我想从MS中输出radius of gyration 随模拟时间变化的文件，不知道各位虫友有什么办法，比如pearl script编程什么的，小弟不甚感激！

[ Last edited by xiaoke413 on 2013-12-19 at 11:46 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-12-19 11:45:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+2, 感谢指导！ 2013-12-20 16:07:02
xiaoke413(月只蓝代发): 金币+30, 感谢指导！ 2014-05-31 21:14:22
月只蓝: 应助指数+1 2014-05-31 21:14:43
peal肯定可以
印象中help里有peal的例子
对于做很多重复性计算很方便


不过貌似radius of gyration还不需要peal
看图
xtd文件导入空白study table
运行QSAR
有radius of gyration的计算
求教radius of gyration(回转半径)相关的问题，谢谢各位虫友！
赞一下(1人) 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

xiaoke413
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2013-12-20 13:53:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoke413

至尊木虫 (职业作家)
送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2013-12-20 13:53:42
peal肯定可以
印象中help里有peal的例子
对于做很多重复性计算很方便


不过貌似radius of gyration还不需要peal
看图
xtd文件导入空白study table
运行QSAR
有radius of gyration的计算
...

感谢您的回答，为什么我不能给你金币啊？
通过您的方法，我把体系导入到study table中了，不过运行失败，可能是因为我的体系是一个含有聚合物和水分子的二元体系，我得怎么样才能在study table中标记处聚合物呢？因为我想在算聚合物的ROG
赞一下 回复此楼
3楼2013-12-23 09:05:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
xiaoke413(月只蓝代发): 金币+20, 感谢指导！ 2014-05-31 21:14:38
月只蓝: 应助指数+1 2014-05-31 21:14:47
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaoke413 at 2013-12-23 09:05:22
感谢您的回答，为什么我不能给你金币啊？
通过您的方法，我把体系导入到study table中了，不过运行失败，可能是因为我的体系是一个含有聚合物和水分子的二元体系，我得怎么样才能在study table中标记处聚合物呢？ ...

确实我也没计算出来。。。

我是在无定型晶胞放的2个小分子。。。
提示不支持周期性结构计算。。。。


这样你只能用forcite计算了。。。。
把xtd导入table
一个个结构复制出来计算。。。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

xiaoke413
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2013-12-23 10:07:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaoke413

至尊木虫 (职业作家)
送红花一朵
月只蓝: 如需代发金币给应助者，请联系版主，并写明金币数量。 2013-12-23 16:15:50
引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2013-12-23 10:07:09
确实我也没计算出来。。。

我是在无定型晶胞放的2个小分子。。。
提示不支持周期性结构计算。。。。


这样你只能用forcite计算了。。。。
把xtd导入table
一个个结构复制出来计算。。。...

谢谢你的帮忙，这种方法虽然比较麻烦，但还是有用的，谢谢了~
不知道为什么金币好像给不了你，再给你一朵红花，真心感谢~
赞一下 回复此楼
5楼2013-12-23 11:34:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-23 16:15:08
引用回帖:
5楼: Originally posted by xiaoke413 at 2013-12-23 11:34:01
谢谢你的帮忙，这种方法虽然比较麻烦，但还是有用的，谢谢了~
不知道为什么金币好像给不了你，再给你一朵红花，真心感谢~...

没事。。。拿不准答案的我不点应助的。。。
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
6楼2013-12-23 13:46:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

S-Loser

新虫 (正式写手)
师兄，可以教教我吗

发自小木虫Android客户端
赞一下 回复此楼
7楼2019-06-19 10:51:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xiaoke413 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 304求调剂 +4 ahbd 2026-03-14 4/200 2026-03-16 16:48 by 我的船我的海
[考研] 一志愿211 0703方向310分求调剂 +3 努力奋斗112 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:44 by houyaoxu
[考研] 0703一志愿211 285分求调剂 +5 ly3471z 2026-03-13 5/250 2026-03-16 16:16 by 哦哦123
[考研] 290求调剂 +5 孔志浩 2026-03-12 10/500 2026-03-16 09:01 by 余晖&
[考研] 22408总分284求调剂 +3 InAspic 2026-03-13 3/150 2026-03-15 11:10 by zhq0425
[考研] 288求调剂 +4 奇点0314 2026-03-14 4/200 2026-03-14 23:04 by JourneyLucky
[考研] 本科南京大学一志愿川大药学327 +3 麦田耕者 2026-03-14 3/150 2026-03-14 20:04 by 外星文明
[考研] 材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流 +4 自由的_飞翔 2026-03-13 5/250 2026-03-14 19:39 by hmn_wj
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 328求调剂 +3 5201314Lsy！ 2026-03-13 6/300 2026-03-14 15:31 by hyswxzs
[考研] 267一志愿南京工业大学0817化工求调剂 +5 SUICHILD 2026-03-12 5/250 2026-03-14 14:53 by jean5056
[考研] 材料工程专硕，一志愿中国矿业大学，总分314，求调剂 +5 无懈可击的巨人 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:37 by JourneyLucky
[考研] 求调剂，一志愿江南大学环境工程085701 +3 Djdjj12 2026-03-10 4/200 2026-03-14 00:31 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 牛乳糖的卡卡 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:05 by JourneyLucky
[考研] 341求调剂 +4 番茄头--- 2026-03-10 4/200 2026-03-13 23:12 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工085600调剂求老师收留 +9 jiaanl 2026-03-11 9/450 2026-03-13 20:22 by JourneyLucky
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 调剂 +5 呵唔哦豁 2026-03-10 5/250 2026-03-10 22:00 by 28375m
[考博] 26申博求助 +3 跳跃饼干 2026-03-10 4/200 2026-03-10 21:15 by Tntcnn
[考研] 一志愿：武汉理工，材料工程，英二数二 总分314 +3 2202020125 2026-03-10 4/200 2026-03-10 13:54 by xiongyaxuan
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭