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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » Mg金屬結構分子模擬
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sf127710627

铜虫 (初入文坛)

[求助] Mg金屬結構分子模擬 已有1人参与

想請問各位大神
我Mg金屬是?膕ample裡面import的結構如附件一
可是為什麼我用discover跑完之後會變成附件二的狀況，照理說金屬原子不是應該不會?y跑嗎?
附件三是我的dynamic setup
同樣的條件我跑Ni或是Cu這種FCC結構就不會有這種問題
想不通為什麼Mg金屬就不能這樣用@@
Mg金屬結構分子模擬
1.PNG


Mg金屬結構分子模擬-1
2.PNG


Mg金屬結構分子模擬-2
3.PNG
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1楼 2013-12-10 11:50:49
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
没有直接在晶胞中跑动力学，在这里只能谈一点个人经验。
600K算是比较高的温度，毕竟镁的熔点不过900K左右，在这样的温度上，本来跑动力学原子就会移动，在比较高的温度下，原子具有的能量更高，移动会更加明显。
现在跳出这个问题来，不知道你为什么要在晶胞里跑动力学，是为了优化晶胞，还是什么？很少见直接在晶胞里跑动力学的。
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MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
2楼2013-12-12 10:07:40
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月只蓝

主管区长 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
sf127710627: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2013-12-12 14:59:17
引用回帖:
4楼: Originally posted by sf127710627 at 2013-12-12 13:47:33
我後?碓赿iscover setup裡面的Non-bond的quality把它?脑镜膄ine改成medium
而且time step改成0.2fs就是一個很穩定的金屬震動方式
所以主要是差在quality嗎?還是time step 1fs太大?...

把单个晶胞扩展为大的超晶胞再跑动力学试试，超晶胞的维度大于non-bond中的cutoff数值。
其他参数都调试一下吧。
赞一下(1人) 回复此楼
MATLAB、MS小问题、普通问题请发帖求助！时间精力有限，恕不接受无偿私信求助。
5楼2013-12-12 13:54:20
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