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爱吃小苹果

新虫 (初入文坛)

[求助] 连接不成功,跪求指导! 已有4人参与

最近在做构建,但是连接连了很久都没连上,一端是平末端,一段是粘性末端,没别的位点可以选了,只能用这个。用的Takara的T4连接酶,连接是按摩尔比加的,1:3,1:5,1:10都用过,还加了PEG4000,4°、16°过夜都试过,平板上会有很多菌落,但是菌落PCR一直都没有条带,应该都试载体自连,片段3000bp,载体4900bp。哪位大神做过类似的,麻烦支支招吧,愁死了!
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achillesyao

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-28 21:06:53
目的片段有3000bp,可以把摩尔比调大一点,你这种情况第一要确定抗生素100%没有失效,是不是抗生素配的时间太久。第二是否双酶切?双酶切不需要去磷酸化。很有可能是你双酶切效率太低。造成的原因有很多,你的保护碱基、内切酶的效率和种类、酶切是否彻底(我一般选好切的酶过夜酶切)、酶切的时间还有纯化时是否干净等等。都排除之后就是连接酶的问题,T4连接酶能提供的吉布斯自由能不酸太高,可能达不到你的反应要求(你的片段是3000bp),可以选用Takara的Solution 1连接酶。不贵,好像是80元-100元。放在16度4h或4度过夜。
23楼2013-12-11 10:37:28
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weishengsu5

木虫 (正式写手)

这个貌似有点大

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2013-12-09 22:43:51
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zhang宇微

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励交流! 2013-12-09 23:37:00
假阳性太多了,可能是载体自连了,所以菌液PCR 什么都没有,很难挑到真阳性。你用什么酶切的,在做连接体系的时候,按1.6%加内切酶在连接反应体系里,连接反应完成后,在37度中让内切酶反应半小时,把自连的载体切开,这样就减少了自连的假阳性。后面在做就能简单点,我也和你一样,现在假阳性是解决了菌液PCR 阳性也很正常,但提了质粒又不对

[ 发自小木虫客户端 ]
3楼2013-12-09 22:52:47
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zhang宇微

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

T 4不是22度吗,四度,十六度不对吧

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2013-12-09 22:54:30
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