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分子模拟 构建盒子环刺穿问题 已有1人参与
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构建10个盒子，结果就只有九个，有时更少。out文件最后是这样说的： 1 frames contain catenated and/or speared rings. EC.arc contains 9 frames after removing bad configurations. the structures in the arc file have not been refined.please use the basic refine protocol to refine these. 我想问下我的这九个盒子还可以继续用不？为什么最后一句话说结构还没有完善？如何完善呢？ 注：我的盒子里加入了200个甲醇分子了，本以为可以防止环穿刺现象的，但是任然有穿刺现象。 还请高手指教，不甚感激！！ |
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