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赵奇一

新虫 (小有名气)

[求助] 运用Gaussian时出现的问题急需解答

初学Gaussian遇到如下问题,希望大神给予解答:
1.优化团簇结构时产生.out文件和.chk两种格式文件,结果发现这两个文件显示的构型并不相同,请问哪个才是优化后得到的构型?
2.计算电子光谱,有的人说用"tddft",为什么这个关键词是错误的,而"td"是正确的?"td"和"tddft"是一回事?
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
赵奇一: 金币+10 2013-12-08 11:09:56
gmy1990: 金币+3 2013-12-08 19:00:54
1、out和chk文件显示的都是优化后的结构。
我猜测,你所谓的不同应该是使用GaussView打开后,发现原子之间的连接情况不一样(比如是否成键,成几重键)。
这个主要是由于GaussView对out和chk文件的不同处理方式造成的。
对于out文件,GaussView不会考虑你输入文件中定义的原子之间的连接方式,而是按照软件默认的设定根据原子之间的距离来显示原子之间的成键情况。由于软件的设置不是一定正确,此时的显示也不一定全部正确。比方说软件定义C-C成键的最大距离是1.64,大于此数值就不显示成键,你能说1.65与1.64的C-C键有什么区别吗?
对于chk文件,由于文件中保存了你在输入文件中定义的连接方式,GaussView在显示时会按照你的定义来显示而不管优化完了原来的连接方式是否正确。

2、在Gaussian软件中,TD是一个单独的关键词,而DFT只是一个学术的词,在Gaussian软件中并不存在这样的关键词,你用DFT做计算需要给出所用的具体泛函。TD可以和任何一个泛函组合,但在输入文件的书写中,二者需要分开写:td是一个,泛函是一个。
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
2楼2013-12-08 09:59:52
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fubest

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
.out文件是优化后得到的构型,看是否正常结束。TD算吸收光谱
3楼2013-12-08 10:05:17
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赵奇一

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hairan at 2013-12-08 09:59:52
1、out和chk文件显示的都是优化后的结构。
我猜测,你所谓的不同应该是使用GaussView打开后,发现原子之间的连接情况不一样(比如是否成键,成几重键)。
这个主要是由于GaussView对out和chk文件的不同处理方式造 ...

刚又发现一问题,如果想让电子能谱的激发态算的尽可能的多,这个与设置的参数有关还是与计算机本身配置有关?
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4楼2013-12-08 11:12:29
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+3 2013-12-08 19:01:04
1、如果正常结束,out和chk文件都可信,可根据不同的需要看不同的文件,比如能量等看out,分子轨道等看chk
2、TD和DFT是完全不同的概念,建议LZ先搞清楚什么是DFT,高斯是如何输入DFT的,什么是TD,你就知道为什么tddft在guassian不是一个关键词了
3、激发态级数可以自己设置,查阅高斯手册或论坛旧帖。
5楼2013-12-08 11:25:23
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hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

★ ★
gmy1990: 金币+2 2013-12-08 19:01:39
引用回帖:
4楼: Originally posted by 赵奇一 at 2013-12-08 11:12:29
刚又发现一问题,如果想让电子能谱的激发态算的尽可能的多,这个与设置的参数有关还是与计算机本身配置有关?...

你要想做计算的话,用到的关键词还是需要好好看看说明书
比如你现在就需要去看TD关键词。
http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_td.htm
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
6楼2013-12-08 12:36:06
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赵奇一

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2013-12-08 11:25:23
1、如果正常结束,out和chk文件都可信,可根据不同的需要看不同的文件,比如能量等看out,分子轨道等看chk
2、TD和DFT是完全不同的概念,建议LZ先搞清楚什么是DFT,高斯是如何输入DFT的,什么是TD,你就知道为什么t ...

对不起啊,我没说清楚。我用相同的方式求激发态,如果设置nstate=100,那么程序就可以完成,如果设置的多了,就不行,提示失败,比如说200。有的元素甚至只能设置成50。我是想问这个是什么原因造成的?是参数设置的问题,还是说我计算机硬件配置比如说内存、CPU问题?
天使可以飞起来是因为他们把自己看得很轻
7楼2013-12-08 13:02:45
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 赵奇一 at 2013-12-08 13:02:45
对不起啊,我没说清楚。我用相同的方式求激发态,如果设置nstate=100,那么程序就可以完成,如果设置的多了,就不行,提示失败,比如说200。有的元素甚至只能设置成50。我是想问这个是什么原因造成的?是参数设置的 ...

异常终止后看出错信息
8楼2013-12-08 15:42:35
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