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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » 求助四张SYBYL结果图，如何成清晰的矢量图，有40金币悬赏
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chentg

木虫 (著名写手)

[求助] 求助四张SYBYL结果图，如何成清晰的矢量图，有40金币悬赏已有1人参与

我有四张SYBYL结果图，也通过PS转换为矢量图（EPS格式），但感觉还是不清楚，请制图大侠们帮忙制成清晰的矢量图，有40金币悬赏。
下面是我上传的JPG格式的四张图，发文章用，请同志们帮帮忙。
求助四张SYBYL结果图，如何成清晰的矢量图，有40金币悬赏
map1.jpg


求助四张SYBYL结果图，如何成清晰的矢量图，有40金币悬赏-1
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求助四张SYBYL结果图，如何成清晰的矢量图，有40金币悬赏-2
map3.jpg


求助四张SYBYL结果图，如何成清晰的矢量图，有40金币悬赏-3
map4.jpg
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我为人人，人人为我。
1楼2013-12-07 16:50:31
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

chentg

木虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by paul34 at 2014-02-13 19:34:06
我是这样的情况，配体在受体中央，用connolly时，配体就被表面包裹住了，只有选择透明才能看见，像你的这种配体处于活性位点的口袋图做不出来啊，还请再教我，有劳有劳。
我详细看了sybyl的图形模块molcad的使用， ...

1,一般配体进入受体都有入口，应该显示出来的。未见过完全被包裹的。
2，如果进入后都包裹了，也只好选择透明显示了。表明二者关系即可。不一定一定要口袋图。
3，你上一你的透明图，我看看是什么原因。位置未摆好？？？
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我为人人，人人为我。
8楼2014-02-14 09:06:15
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chentg

木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by paul34 at 2014-02-14 10:04:43
我是看了sybyl的说明书在练习，使用的surflex-dock教程中1kim这个结构，配体入口很小，请见图。
我以前用MOE，有个功能是通过滑块将选中的部分逐渐淡化的功能，可以比较好的显示出口袋，这两天把sybyl的说明书相关 ...

看了你的图，入口较小，受体几乎把配体包裹了，只好是透明图了。否则你即使显示出口袋图，别人得把脑袋伸到口袋里看配体在受体中的位置了。哈哈。
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我为人人，人人为我。
10楼2014-02-14 16:24:17
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普通回帖

chentg

木虫 (著名写手)
没有人应助吗？
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我为人人，人人为我。
2楼2013-12-07 17:46:59
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126406380

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2013-12-15 09:14:42
chentg: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢您的帮助。 2013-12-16 07:07:16
其实直接在SYBLY中弄好，再到画图和PS外加PPT就可以了。大概4、5种软件综合使用。
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成功是一种标志
3楼2013-12-14 14:02:44
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paul34

木虫 (初入文坛)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-14 15:01:47
请问下map1,map3的图怎么实现的，我使用molcad，seperated可看到两个表面，但是作不出你这样的配体在受体空腔的效果图，还请指教！
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4楼2014-02-12 21:04:43
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chentg

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by paul34 at 2014-02-12 21:04:43
请问下map1,map3的图怎么实现的，我使用molcad，seperated可看到两个表面，但是作不出你这样的配体在受体空腔的效果图，还请指教！

我用的是SYBYL,没有用过molcad，seperated，用SYBYL时，先选择受体，然后在显示里选择quick surface,然后再选择connolly即可。
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我为人人，人人为我。
5楼2014-02-13 16:13:27
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chentg

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by paul34 at 2014-02-12 21:04:43
请问下map1,map3的图怎么实现的，我使用molcad，seperated可看到两个表面，但是作不出你这样的配体在受体空腔的效果图，还请指教！

已回复，注意查看。
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我为人人，人人为我。
6楼2014-02-13 16:14:19
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paul34

木虫 (初入文坛)
★
月只蓝: 金币+1, 鼓励交流！ 2014-02-14 15:01:56
我是这样的情况，配体在受体中央，用connolly时，配体就被表面包裹住了，只有选择透明才能看见，像你的这种配体处于活性位点的口袋图做不出来啊，还请再教我，有劳有劳。
我详细看了sybyl的图形模块molcad的使用，可是没有找到办法。
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7楼2014-02-13 19:34:06
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paul34

木虫 (初入文坛)
★ ★
月只蓝: 金币+2, 鼓励交流！ 2014-02-14 15:02:13
我是看了sybyl的说明书在练习，使用的surflex-dock教程中1kim这个结构，配体入口很小，请见图。
我以前用MOE，有个功能是通过滑块将选中的部分逐渐淡化的功能，可以比较好的显示出口袋，这两天把sybyl的说明书相关内容还有网上视屏都看了，应该是只能做到图片的程度，顶多加上透明的效果。看来要么使用多种软件配合，要么就凑活了。
不过感觉sybyl的对接技术还有qsar更牛啊。
求助四张SYBYL结果图，如何成清晰的矢量图，有40金币悬赏-4
1.jpg
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9楼2014-02-14 10:04:43
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