| 查看: 1699 | 回复: 7 | ||
[求助]
数字化表达谱中，Mismatch Reads、Indel Reads等都是什么意思啊？
|
|
Mapped Reads和Perfect Mapped Reads有什么区别？ Mismatch Reads和Indel Reads又是什么意思呢？ |
回复此楼» 猜你喜欢
科研人必读：新一代 KRAS G12C 抑制剂 Olomorasib 的研究进展
已经有0人回复
-
BT-11（Omilancor）研究化合物全解析：从分子结构到实验应用要点
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有179人回复
-
富马酸贝达喹啉：二芳基喹啉类工具化合物的化学特征
已经有0人回复
-
BT投稿with editor状态快两周了，正常吗
已经有25人回复
-
Silevertinib（BDTX-1535）结构拆解：炔基双环片段为何成为合成瓶颈
已经有0人回复
-
RO4929097 解析：双苯并氮杂䓬骨架与 Notch 通路实验设计要点
已经有0人回复
-
分子量 1157 的 PROTAC 怎么配不析出：SGK3-PROTAC1 的溶解、分装与图谱复核
已经有0人回复
-
logP 6.1 的羧酸怎么配母液：GSK 650394 的溶解窗口与稀释顺序
已经有0人回复
-
从"水不溶"到 71 mg/mL：雷特格韦的 pH 依赖溶解与螯合色谱边界
已经有0人回复
-
133 Ų 的极性表面积，如何决定 TNG462 的母液配制与色谱条件
已经有0人回复
gaoyang636
木虫 (著名写手)
- MolEPI: 5
- 应助: 202 (大学生)
- 金币: 4111.4
- 散金: 7
- 红花: 14
- 帖子: 1108
- 在线: 159.8小时
- 虫号: 384065
- 注册: 2007-05-27
- 专业: 基因组学
2楼2013-12-06 17:24:45
bullfrog325
木虫 (正式写手)
- MolEPI: 1
- 应助: 193 (高中生)
- 金币: 2880.3
- 散金: 200
- 红花: 24
- 帖子: 744
- 在线: 269.5小时
- 虫号: 1864929
- 注册: 2012-06-20
3楼2013-12-06 18:08:53
这个当然知道了 4楼2013-12-06 19:05:23
5楼2013-12-06 19:05:35
gaoyang636
木虫 (著名写手)
- MolEPI: 5
- 应助: 202 (大学生)
- 金币: 4111.4
- 散金: 7
- 红花: 14
- 帖子: 1108
- 在线: 159.8小时
- 虫号: 384065
- 注册: 2007-05-27
- 专业: 基因组学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wxl007777: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 谢谢了，那是不是说，20bp允许一个mismatch就是mapped？ 2013-12-06 22:29:25
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-06 23:04:10
感谢参与，应助指数 +1
wxl007777: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 谢谢了，那是不是说，20bp允许一个mismatch就是mapped？ 2013-12-06 22:29:25
gyesang: 金币+2, 鼓励交流！ 2013-12-06 23:04:10
|
indel reads应该就是这个（些）reads在mapping的时候，有indel现象（insert-deletion） 同样地，mismatch reads就是存在mismatch，比如：reference是 .....ACGTG....; reads是.....ACGGG.... 这里有一个base的mismatch。 |
6楼2013-12-06 20:35:40
7楼2013-12-06 22:29:30
8楼2017-08-29 09:26:32
