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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于16S rRNA基因绝对荧光定量的问题
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lemian

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by ice-bamboo at 2014-06-14 10:57:45
请问大侠：您的“绝对荧光定量做了16S rRNA基因V4区的分析”中的标准曲线是怎么做的啊？我看文献中是用“reference bacteria”但却不知道他们是怎么选参考菌的。

标曲前半部分是别人帮做的。大概是拿细菌样品去扩16s v4区，然后导入质粒，转入大肠杆菌，挑单克隆测序。然后将此单克隆扩大培养以后提取质粒DNA,然后用分光测DNA浓度，然后再剃度稀释该DNA，以此为模版去做定量pcr就是标曲了。

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11楼2014-06-15 15:51:57
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lemian

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by ice-bamboo at 2014-06-14 10:57:45
请问大侠：您的“绝对荧光定量做了16S rRNA基因V4区的分析”中的标准曲线是怎么做的啊？我看文献中是用“reference bacteria”但却不知道他们是怎么选参考菌的。

挑选应该是细菌都可以，反正你要测序知道它是什么细菌就OK了。

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12楼2014-06-15 15:53:26
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zhenmei212

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
lemian: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 非常感谢 2014-08-06 08:24:49
可以的，我的就是这么做的，文章已接收，并且之前有看到一篇文献也是这么做的。
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13楼2014-08-05 15:42:39
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lemian

木虫 (正式写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by zhenmei212 at 2014-08-05 15:42:39
可以的，我的就是这么做的，文章已接收，并且之前有看到一篇文献也是这么做的。

我文章也接受了，也是这么做的。还是要谢谢你。

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14楼2014-08-06 08:26:01
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zhenmei212

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
14楼: Originally posted by lemian at 2014-08-06 08:26:01
我文章也接受了，也是这么做的。还是要谢谢你。
...

恭喜
15楼2014-08-08 14:02:08
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小佳佳佳佳

新虫 (初入文坛)
二位方便给个文章题目吗？小白来参考
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16楼2014-11-19 10:25:50
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lemian

木虫 (正式写手)
引用回帖:
16楼: Originally posted by 小佳佳佳佳 at 2014-11-19 10:25:50
二位方便给个文章题目吗？小白来参考

忘记回了，论文请见下

Liu LM et al. Synchronous dynamics and correlations between bacteria and phytoplankton in a subtropical drinking water reservoir. FEMS Microbiol Ecol 90 (2014): 126–138

http://onlinelibrary.wiley.com/d ... 6941.12378/abstract
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17楼2014-11-22 14:23:54
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hui113sheng

新虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by ice-bamboo at 2014-06-14 10:57:45
请问大侠：您的“绝对荧光定量做了16S rRNA基因V4区的分析”中的标准曲线是怎么做的啊？我看文献中是用“reference bacteria”但却不知道他们是怎么选参考菌的。

同问
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18楼2019-05-05 12:22:36
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