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lemian木虫 (正式写手)
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关于16S rRNA基因绝对荧光定量的问题 已有1人参与
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虫友们,我想请教一个问题。 我有一批样品做了16S rRNA基因V3-V5区高通量测序,得到了一个OTU相对丰度矩阵。然后我用绝对荧光定量做了16S rRNA基因V4区的分析,得到了原始DNA 16S rRNA基因的拷贝数。我想能不能在每个样品中用OTU相对丰度乘以荧光定量获得的该样品的拷贝数,最终能不能得到一个OTU绝对丰度的矩阵。然后用于后续分析,如alpha多样性beta多样性等。 |
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lemian
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忘记回了,论文请见下 Liu LM et al. Synchronous dynamics and correlations between bacteria and phytoplankton in a subtropical drinking water reservoir. FEMS Microbiol Ecol 90 (2014): 126–138 http://onlinelibrary.wiley.com/d ... 6941.12378/abstract |
17楼2014-11-22 14:23:54
lemian
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4楼2013-12-04 10:48:42
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5楼2013-12-04 12:59:43










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